Project Details
Description
Svampsläktet Cortinarius (spindlingar) tros kombinera mykorrhiza-symbios med en välutvecklad kapacitet att bryta ned organiskt material och spela en nyckelroll i boreala skogsekosystem. I ett doktorandprojekt, med samarbete mellan SLU, Lund, INRAE i Nancy och Kew Gardens i London, kommer detta svampsläkte att studeras utifrån ekologiska, taxonomiska, genetiska och biokemiska synvinklar.
Evolutionen av nedbrytar-enzymet Mn-peroxidas kommer att studeras baserat på mRNA-sekvenser från skogsmark och genom-sekvenser från Cortinarius fruktkroppar. Mn-peroxidaser från Cortinarius kommer att uttryckas rekombinant och deras biokemiska förmåga att bryta ned organiskt material kommer at studeras in vitro med isotopinmärkta substrat, spektroskopi och tester av biotillgänglighet. Genom att analysera svampsamhällen och enzymaktiviteter i 2600 markprover kommer vi att fastställa statistiska samband mellan Cortinarius-arter och enzymproduktion. Ekologiska samband mellan svampsamhällen, miljövariabler och organiskt material i marken kommer att analyseras med statistisk modellering.Detta breda projekt driver forskningsfronten när det gäller funktionell karakterisering av svampar som är svåra att odla på lab och observera i fält. Vi testar nya hypoteser om hur interaktioner mellan växter, svampar och marken upprätthåller markens bördighet och motverkar ekosystemens retrogression. Kunskapen är viktig för att underbygga hållbar skogsskötsel och förutse effekter av klimatförändringar.
Evolutionen av nedbrytar-enzymet Mn-peroxidas kommer att studeras baserat på mRNA-sekvenser från skogsmark och genom-sekvenser från Cortinarius fruktkroppar. Mn-peroxidaser från Cortinarius kommer att uttryckas rekombinant och deras biokemiska förmåga att bryta ned organiskt material kommer at studeras in vitro med isotopinmärkta substrat, spektroskopi och tester av biotillgänglighet. Genom att analysera svampsamhällen och enzymaktiviteter i 2600 markprover kommer vi att fastställa statistiska samband mellan Cortinarius-arter och enzymproduktion. Ekologiska samband mellan svampsamhällen, miljövariabler och organiskt material i marken kommer att analyseras med statistisk modellering.Detta breda projekt driver forskningsfronten när det gäller funktionell karakterisering av svampar som är svåra att odla på lab och observera i fält. Vi testar nya hypoteser om hur interaktioner mellan växter, svampar och marken upprätthåller markens bördighet och motverkar ekosystemens retrogression. Kunskapen är viktig för att underbygga hållbar skogsskötsel och förutse effekter av klimatförändringar.
Status | Finished |
---|---|
Effective start/end date | 2021/01/01 → 2023/12/31 |
Collaborative partners
- Lund University
- Swedish University of Agricultural Sciences (lead)
- Royal Botanic Gardens, Kew