Genomisk karakterisering av trippelnegativ bröstcancer (TNBC)

Project: Research

Research areas and keywords

UKÄ subject classification

  • Medical and Health Sciences

Keywords

Description

Trippelnegativ bröstcancer (TNBC) representerar ca 9% av all bröstcancer i Sverige. TNBC är starkt associerad till förändringar i BRCA1 genen vilken orsakar en stor andel av ärftlig bröstcancer. BRCA1 är en central gen i DNA reparation, vilket därmed kopplar TNBC till även DNA reparations defekter. Genom bred genomisk karakterisering av DNA, RNA, epigenetiska och protein förändringar i TNBC undersöks den kliniska betydelsen av olika signaturer avseende exempelvis prognos efter standardterapi. Genom integration av multipla lager av genomisk data vill vi karakterisera det molekylära landskapet i TNBC, med mål att skapa en ny integrerad molekylär taxonomi genom avancerad bioinformatik.

Layman's description

Trippelnegativ bröstcancer (TNBC) representerar ca 9% av all bröstcancer i Sverige. Karakteristiskt för bröstcancerformen är att den oftare drabbar yngre kvinnor, har en betydande ärftlig komponent och ger tidiga återfall. Det är en klinisk subgrupp av bröstcancer för vilken det fortfarande saknas biomarkörer och möjlighet till riktad behandling. Detta projekt syftar bland annat till att förbättra vår förståelse på helgenom basis av vilka förändringar som finns på DNA, RNA, epigenetisk, och proteinnivå i TNBC och huruvida dessa kan omsättas till ny diagnostik, prognostik, och terapival.
Short titleTNBC genomik
StatusActive
Effective start/end date2019/07/01 → 2025/10/01

Collaborative partners

Participants

Related research output

Cross comparison and prognostic assessment of breast cancer multigene signatures in a large population-based contemporary clinical series
Johan Vallon-Christersson, Jari Häkkinen, Cecilia Hegardt, Lao Saal, Christer Larsson, Anna Ehinger, H Lindman, Helena Olofsson, Tobias Sjoblom, Fredrik Wärnberg, Lisa Rydén, Niklas Loman, Martin Malmberg, Åke Borg & Johan Staaf, 2019 Aug 21, In: Scientific Reports. 9, 12184.

Research output: Contribution to journal › Article

Prediction of lymph node metastasis in breast cancer by gene expression and clinicopathological models: Development and validation within a population based cohort.
Looket Dihge, Johan Vallon-Christersson, Cecilia Hegardt, Lao Saal, Jari Häkkinen, Christer Larsson, Anna Ehinger, Niklas Loman, Martin Malmberg, Pär-Ola Bendahl, Åke Borg, Johan Staaf & Lisa Rydén, 2019 Jul 24, In: Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research. 25, 21, p. 6368-6381

Research output: Contribution to journal › Article

Whole-genome sequencing of triple-negative breast cancers in a population-based clinical study
Johan Staaf, Dominik Glodzik, Ana Bosch, Johan Vallon-Christersson, Christel Reuterswärd, Jari Häkkinen, Andrea Degasperi, Tauanne Dias Amarante, Lao H Saal, Cecilia Hegardt, Hilary Stobart, Anna Ehinger, Christer Larsson, Lisa Rydén, Niklas Loman, Martin Malmberg, Anders Kvist, Hans Ehrencrona, Helen R Davies, Åke Borg & 1 others, Serena Nik-Zainal, 2019, In: Nature Medicine. 25, p. 1526–1533

Research output: Contribution to journal › Article

View all (7)

Related prizes

Senior Investigator Award - Swedish Cancer Society 2019

Johan Staaf (Recipient), 2019

Prizes and Distinctions: Other distinction

View all (1)