Bioinformatics, 1367-4803

Tidskrift

Fler filtreringsmöjligheter
  1. 2019
  2. SMSSVD: SubMatrix Selection Singular Value Decomposition

    Rasmus Henningsson & Fontes, M., 2019, I : Bioinformatics (Oxford, England). 35, 3, s. 478-486 9 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  3. Uncertainty quantification, propagation and characterization by Bayesian analysis combined with global sensitivity analysis applied to dynamical intracellular pathway models

    Eriksson, O., Jauhiainen, A., Sara Maad Sasane, Kramer, A., Nair, A. G., Sartorius, C. & Hellgren Kotaleski, J., 2019, I : Bioinformatics (Oxford, England). 35, 2, s. 284-292 9 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  4. 2018
  5. Using standard microbiome reference groups to simplify beta-diversity analyses and facilitate independent validation

    Marlena Maziarz, Pfeiffer, R. M., Wan, Y. & Gail, M. H., 2018 okt 1, I : Bioinformatics. 34, 19, s. 3249-3257 9 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  6. 2017
  7. LoFtool: a gene intolerance score based on loss-of-function variants in 60 706 individuals

    Fadista, J., Nikolay Oskolkov, Ola Hansson & Leif Groop, 2017, I : Bioinformatics. 33, 4, s. 471-474

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  8. 2016
  9. PON-Sol: Prediction of effects of amino acid substitutions on protein solubility

    Yang, Y., Abhishek Niroula, Shen, B. & Mauno Vihinen, 2016 jul 1, I : Bioinformatics. 32, 13, s. 2032-2034

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  10. 2015
  11. Automatic determination of NET (neutrophil extracellular traps) coverage in fluorescent microscopy images

    Coelho, L. P., Pato, C., Friães, A., Neumann, A., von Köckritz-Blickwede, M., Ramirez, M. & Carriço, J. A., 2015 jul 15, I : Bioinformatics. 31, 14, s. 2364-70 7 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  12. DIANA - algorithmic improvements for analysis of data-independent acquisition MS data.

    Teleman, J., Röst, H., Rosenberger, G., Schmitt, U., Malmström, L., Johan Malmström & Fredrik Levander, 2015, I : Bioinformatics. 31, 4, s. 555-562

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  13. EVpedia: A Community Web Portal for Extracellular Vesicles Research.

    Kim, D-K., Lee, J., Kim, S. R., Choi, D-S., Yoon, Y. J., Kim, J. H., Go, G., Nhung, D., Hong, K., Jang, S. C., Kim, S-H., Park, K-S., Kim, O. Y., Park, H. T., Seo, J. H., Aikawa, E., Baj-Krzyworzeka, M., van Balkom, B. W. M., Belting, M., Blanc, L. & 75 andraBond, V., Bongiovanni, A., Borràs, F. E., Buée, L., Buzás, E. I., Cheng, L., Clayton, A., Cocucci, E., Dela Cruz, C. S., Desiderio, D. M., Di Vizio, D., Ekström, K., Falcon-Perez, J. M., Gardiner, C., Giebel, B., Greening, D. W., Gross, J. C., Gupta, D., Hendrix, A., Hill, A. F., Hill, M. M., Nolte-'t Hoen, E., Hwang, D. W., Inal, J., Jagannadham, M. V., Jayachandran, M., Jee, Y-K., Jørgensen, M., Kim, K. P., Kim, Y-K., Kislinger, T., Lässer, C., Lee, D. S., Lee, H., van Leeuwen, J., Lener, T., Liu, M-L., Lötvall, J., Marcilla, A., Mathivanan, S., Möller, A., Morhayim, J., Mullier, F., Nazarenko, I., Nieuwland, R., Nunes, D. N., Pang, K., Park, J., Patel, T., Pocsfalvi, G., Del Portillo, H., Putz, U., Ramirez, M. I., Rodrigues, M. L., Roh, T-Y., Royo, F., Sahoo, S., Schiffelers, R., Sharma, S., Siljander, P., Simpson, R. J., Soekmadji, C., Stahl, P., Stensballe, A., Stępień, E., Tahara, H., Trummer, A., Valadi, H., Vella, L. J., Wai, S. N., Witwer, K., Yáñez-Mó, M., Youn, H., Zeidler, R. & Gho, Y. S., 2015, I : Bioinformatics. 31, 6, s. 933-939

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  14. 2013
  15. SBSI: an extensible distributed software infrastructure for parameter estimation in systems biology

    Adams, R., Clark, A., Yamaguchi, A., Hanlon, N., Tsorman, N., Ali, S., Lebedeva, G., Goltsov, A., Sorokin, A., Akman, O. E., Carl Troein, Millar, A. J., Goryanin, I. & Gilmore, S., 2013, I : Bioinformatics. 29, 5, s. 664-665

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  16. Ultranet: efficient solver for the sparse inverse covariance selection problem in gene network modeling.

    Järvstråt, L., Johansson, M., Urban Gullberg & Nilsson, B., 2013, I : Bioinformatics. 29, 4, s. 511-512

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  17. 2012
  18. Analysis of case-control association studies with known risk variants

    Zaitlen, N., Pasaniuc, B., Patterson, N., Pollack, S., Voight, B., Leif Groop, Altshuler, D., Henderson, B. E., Kolonel, L. N., Le Marchand, L., Waters, K., Haiman, C. A., Stranger, B. E., Dermitzakis, E. T., Kraft, P. & Price, A. L., 2012, I : Bioinformatics. 28, 13, s. 1729-1737

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  19. 2009
  20. Modified variational bayes EM estimation of hidden markov tree model of cell lineages

    Victor Olariu, Coca, D., Billings, S. A., Tonge, P., Gokhale, P., Andrews, P. W. & Kadirkamanathan, V., 2009 nov 1, I : Bioinformatics. 25, 21, s. 2824-2830 7 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  21. RAMI: a tool for identification and characterization of phylogenetic clusters in microbial communities

    Pommier, T., Canback, B., Per Lundberg, Hagstrom, A. & Anders Tunlid, 2009, I : Bioinformatics. 25, 6, s. 736-742

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  22. Ultrasome: efficient aberration caller for copy number studies of ultra-high resolution

    Björn Nilsson, Johansson, M., Al-Shahrour, F., Carpenter, A. E. & Ebert, B. L., 2009, I : Bioinformatics. 25, 8, s. 1078-1079

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  23. 2008
  24. Model-based prediction of sequence alignment quality.

    Ahola, V., Aittokallio, T., Mauno Vihinen & Uusipaikka, E., 2008, I : Bioinformatics. 24, 19, s. 2165-2171

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  25. 2007
  26. Continuous-index hidden Markov modelling of array CGH copy number data.

    Stjernqvist, S., Rydén, T., Sköld, M. & Johan Staaf, 2007, I : Bioinformatics. 23, s. 1006-1014

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  27. Multiple spaced seeds for homology search

    Ilie, L. & Ilie, S., 2007, I : Bioinformatics. 23, 22, s. 2969-2977

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  28. Regression analysis and modelling of data acquisition for SELDI-TOF mass spectrometry.

    Sköld, M., Rydén, T., Samuelsson, V., Charlotte Welinder, Lars Ekblad, Håkan Olsson & Bo Baldetorp, 2007, I : Bioinformatics. 23, 11, s. 1401-1409

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  29. Robust smooth segmentation approach for array CGH data analysis

    Huang, J., Gusnanto, A., O'Sullivan, K., Johan Staaf, Åke Borg & Pawitan, Y., 2007, I : Bioinformatics. 23, 18, s. 2463-2469

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  30. 2005
  31. CoGenT++: an extensive and extensible data environment for computational genomics

    Goldovsky, L., Janssen, P., Dag Ahrén, Audit, B., Cases, I., Darzentas, N., Enright, A., López-Bigas, N., Peregrin-Alvarez, J., Smith, M., Tsoka, S., Kunin, V. & Ouzounis, C., 2005, I : Bioinformatics. 21, 19, s. 3806-3810

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  32. Modeling the organization of the WUSCHEL expression domain in the shoot apical meristem

    Henrik Jönsson, Heisler, M., Reddy, GV., Agrawal, V., Gor, V., Shapiro, BE., Mjolsness, E. & Meyerowitz, EM., 2005, I : Bioinformatics. 21, Suppl 1, s. I232-I240

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  33. PROTEIOS: an open source proteomics initiative

    Gärdén, P., Alm, R. & Jari Häkkinen, 2005, I : Bioinformatics. 21, 9, s. 2085-2087

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  34. 2004
  35. ACID: a database for microarray clone information

    Markus Ringnér, Srinivas Veerla, Andersson, S., Johan Staaf & Jari Häkkinen, 2004, I : Bioinformatics. 20, 14, s. 2305-2306

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  36. Approximate geodesic distances reveal biologically relevant structures in microarray data

    Nilsson, J., Thoas Fioretos, Mattias Höglund & Fontes, M., 2004, I : Bioinformatics. 20, 6, s. 874-880

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  37. Modular, scriptable and automated analysis tools for high-throughput peptide mass fingerprinting

    Samuelsson, J., Dalevi, D., Fredrik Levander & Rognvaldsson, T., 2004, I : Bioinformatics. 20, 18, s. 3628-3635

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  38. 2003
  39. Efficient estimation of emission probabilities in profile hidden Markov models.

    Ahola, V., Aittokallio, T., Uusipaikka, E. & Mauno Vihinen, 2003, I : Bioinformatics. 19, 18, s. 2359-2368

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  40. RankViaContact: ranking and visualization of amino acid contacts.

    Shen, B. & Mauno Vihinen, 2003, I : Bioinformatics. 19, 16, s. 2161-2162

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  41. 2002
  42. Binary tree-structured vector quantization approach to clustering and visualizing microarray data

    Sultan, M., Wigle, D. A., Cumbaa, C. A., M. Maziarz, Glasgow, J., Tsao, M. S. & Jurisica, I., 2002 jan 1, I : Bioinformatics. 18, SUPPL. 1

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  43. A novel approach to local reliability of sequence alignments.

    Schlosshauer, M. & Mattias Ohlsson, 2002, I : Bioinformatics. 18, 6, s. 847-854

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  44. 2001
  45. BioWAP, mobile Internet service for bioinformatics

    Riikonen, P., Boberg, J., Salakoski, T. & Mauno Vihinen, 2001, I : Bioinformatics. 17, 9, s. 855-856

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  46. 1999
  47. MUTbase: maintenance and analysis of distributed mutation databases

    Riikonen, P. & Mauno Vihinen, 1999, I : Bioinformatics. 15, 10, s. 852-859

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  48. 1995
  49. MIST - A user-friendly metabolic simulator

    Ehlde, M. & Guido Zacchi, 1995, I : Computer Applications in the Biosciences. 11, 2, s. 201-207

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  50. 1992
  51. MULTICOMP - A PROGRAM PACKAGE FOR MULTIPLE SEQUENCE COMPARISON

    Mauno Vihinen, EURANTO, A., LUOSTARINEN, P. & NEVALAINEN, O., 1992, I : Computer Applications in the Biosciences. 8, 1, s. 35-38

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  52. 1988
  53. AN ALGORITHM FOR SIMULTANEOUS COMPARISON OF SEVERAL SEQUENCES

    Mauno Vihinen, 1988, I : Computer Applications in the Biosciences. 4, 1, s. 89-92

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift