Mauno Vihinen

Professor
Fler filtreringsmöjligheter
  1. 2019
  2. Benchmarking subcellular localization and variant tolerance predictors on membrane proteins

    Orioli, T. & Mauno Vihinen, 2019 jul 16, I : BMC Genomics. 20, 8, 547.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  3. FGF family members differentially regulate maturation and proliferation of stem cell-derived astrocytes

    Ekaterina Savchenko, Teku, G. N., Antonio Boza-Serrano, Kaspar Russ, Berns, M., Tomas Deierborg, Lamas, N. J., Wichterle, H., Rothstein, J., Henderson, C. E., Mauno Vihinen & Laurent Roybon, 2019 jul 3, I : Scientific Reports. 9, 1, 9610.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  4. How good are pathogenicity predictors in detecting benign variants?

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2019 feb 11, I : PLoS Computational Biology. 15, 2, e1006481.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  5. Checklist for gene/disease-specific variation database curators to enable ethical data management

    Ekong, R. & Mauno Vihinen, 2019, I : Human Mutation.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  6. 2018
  7. Systematics for types and effects of DNA variations

    Mauno Vihinen, 2018 dec 28, I : BMC Genomics. 19, 1, 974.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikel

  8. Pan-cancer analysis of neoepitopes

    Teku, G. N. & Mauno Vihinen, 2018 dec 1, I : Scientific Reports. 8, 1, 12735.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  9. Representativeness of variation benchmark datasets

    Gerard C P Schaafsma & Mauno Vihinen, 2018 nov 29, I : BMC Bioinformatics. 19, 1, s. 461

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  10. Simulation of the dynamics of primary immunodeficiencies in B cells

    Teku, G. N. & Mauno Vihinen, 2018 aug 2, I : Frontiers in Immunology. 9, AUG, 1785.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  11. Mu transpososome activity-profiling yields hyperactive MuA variants for highly efficient genetic and genome engineering

    Rasila, T. S., Pulkkinen, E., Kiljunen, S., Haapa-Paananen, S., Pajunen, M. I., Salminen, A., Paulin, L., Mauno Vihinen, Rice, P. A. & Savilahti, H., 2018 maj 18, I : Nucleic Acids Research. 46, 9, s. 4649-4661 13 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  12. Pon-tstab: Protein variant stability predictor. importance of training data quality

    Yang, Y., Urolagin, S., Abhishek Niroula, Ding, X., Shen, B. & Mauno Vihinen, 2018 apr 1, I : International Journal of Molecular Sciences. 19, 4, 1009.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  13. NDDVD: an integrated and manually curated Neurodegenerative Diseases Variation Database

    Yang, Y., Xu, C., Liu, X., Xu, C., Zhang, Y., Shen, L., Mauno Vihinen & Shen, B., 2018 jan 1, I : Database : the journal of biological databases and curation. 2018, bay018.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  14. 2017
  15. PON-SC - program for identifying steric clashes caused by amino acid substitutions

    Čalyševa, J. & Mauno Vihinen, 2017 nov 29, I : BMC Bioinformatics. 18, 1, 531.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  16. Simulation of the dynamics of primary immunodeficiencies in CD4+ T-cells

    Teku, G. N. & Mauno Vihinen, 2017 apr 1, I : PLoS ONE. 12, 4, 0176500.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  17. How to Define Pathogenicity, Health, and Disease?

    Mauno Vihinen, 2017 feb 1, I : Human Mutation. 38, 2, s. 129-136 8 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  18. Expanded national database collection and data coverage in the FINDbase worldwide database for clinically relevant genomic variation allele frequencies

    Viennas, E., Komianou, A., Mizzi, C., Stojiljkovic, M., Mitropoulou, C., Muilu, J., Mauno Vihinen, Grypioti, P., Papadaki, S., Pavlidis, C., Zukic, B., Katsila, T., Van Der Spek, P. J., Pavlovic, S., Tzimas, G. & Patrinos, G. P., 2017 jan 1, I : Nucleic Acids Research. 45, D1, s. D846-D853

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  19. One Gene, Several Diseases: The Characteristics of Pleiotropic Proteins

    Mauno Vihinen, 2017, I : Human Mutation. 38, 3, s. 241-241 1 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragDebate/Note/Editorial

  20. Performance of in silico tools for the evaluation of p16INK4a (CDKN2A) variants in CAGI

    Carraro, M., Minervini, G., Giollo, M., Bromberg, Y., Capriotti, E., Casadio, R., Dunbrack, R., Elefanti, L., Fariselli, P., Ferrari, C., Gough, J., Katsonis, P., Leonardi, E., Lichtarge, O., Menin, C., Martelli, P. L., Niroula, A., Pal, L. R., Repo, S., Scaini, M. C. & 11 andraMauno Vihinen, Wei, Q., Xu, Q., Yang, Y., Yin, Y., Zaucha, J., Zhao, H., Zhou, Y., Brenner, S. E., Moult, J. & Tosatto, S. C. E., 2017, I : Human Mutation. 38, 9, s. 1042-1050

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  21. PON-P and PON-P2 predictor performance in CAGI challenges: Lessons learned

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2017, I : Human Mutation. 38, 9, s. 1085-1091

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  22. Working toward precision medicine: Predicting phenotypes from exomes in the Critical Assessment of Genome Interpretation (CAGI) challenges

    Daneshjou, R., Wang, Y., Bromberg, Y., Bovo, S., Martelli, P. L., Babbi, G., Lena, P. D., Casadio, R., Edwards, M., Gifford, D., Jones, D. T. W., Sundaram, L., Bhat, R., Li, X., Pal, L. R., Kundu, K., Yin, Y., Moult, J., Jiang, Y., Pejaver, V. R. & 31 andraPagel, K. A., Li, B., Mooney, S. D., Radivojac, P., Shah, S., Carraro, M., Gasparini, A., Leonardi, E., Giollo, M., Ferrari, C., Tosatto, S. C. E., Bachar, E., Azaria, J. R., Ofran, Y., Unger, R., Abhishek Niroula, Mauno Vihinen, Chang, B., Wang, M. H., Franke, A., Petersen, B. S., Pirooznia, M., Zandi, P., Mccombie, R., Potash, J. B., Altman, R. B., Klein, T. E., Hoskins, R. A., Repo, S., Brenner, S. E. & Morgan, A. A., 2017, I : Human Mutation. 38, 9, s. 1182-1192

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  23. 2016
  24. Both Generic and Protein-Specific Tolerance Predictors Are Needed

    Mauno Vihinen, 2016 okt 1, I : Human Mutation. 37, 10, s. 989 1 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragDebate/Note/Editorial

  25. Establishment of an international database for genetic variants in esophageal cancer

    Mauno Vihinen, 2016 okt 1, I : Annals of the New York Academy of Sciences. 1381, 1, s. 45-49 5 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  26. PON-Sol: Prediction of effects of amino acid substitutions on protein solubility

    Yang, Y., Abhishek Niroula, Shen, B. & Mauno Vihinen, 2016 jul 1, I : Bioinformatics. 32, 13, s. 2032-2034

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  27. Variation Interpretation Predictors: Principles, Types, Performance, and Choice

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2016 jun 1, I : Human Mutation. 37, 6, s. 579-597 19 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  28. Human Variome Project Quality Assessment Criteria for Variation Databases.

    Mauno Vihinen, Hancock, J. M., Maglott, D. R., Landrum, M. J., Gerard Schaafsma & Taschner, P., 2016, I : Human Mutation. 37, 6, s. 549 558 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  29. PON-mt-tRNA: a multifactorial probability-based method for classification of mitochondrial tRNA variations.

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2016, I : Nucleic Acids Research. 44, 5, s. 2020-2027

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  30. VariOtator, A Software Tool for Variation Annotation with the Variation Ontology.

    Gerard Schaafsma & Mauno Vihinen, 2016, I : Human Mutation. 37, 4, s. 344-349

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  31. 2015
  32. Characterization of All Possible Single-Nucleotide Change Caused Amino Acid Substitutions in the Kinase Domain of Bruton Tyrosine Kinase

    Valiaho, J., Faisal, I., Ortutay, C., Smith, C. I. E. & Mauno Vihinen, 2015, I : Human Mutation. 36, 6, s. 638-647

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  33. Classification of Amino Acid Substitutions in Mismatch Repair Proteins Using PON-MMR2.

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2015, I : Human Mutation. 36, 12, s. 1128-1134

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  34. Finding Our Way through Phenotypes.

    Deans, A. R., Lewis, S. E., Huala, E., Anzaldo, S. S., Ashburner, M., Balhoff, J. P., Blackburn, D. C., Blake, J. A., Burleigh, J. G., Chanet, B., Cooper, L. D., Courtot, M., Csösz, S., Cui, H., Dahdul, W., Das, S., Dececchi, T. A., Dettai, A., Diogo, R., Druzinsky, R. E. & 54 andraDumontier, M., Franz, N. M., Friedrich, F., Gkoutos, G. V., Haendel, M., Harmon, L. J., Hayamizu, T. F., He, Y., Hines, H. M., Ibrahim, N., Jackson, L. M., Jaiswal, P., James-Zorn, C., Köhler, S., Lecointre, G., Lapp, H., Lawrence, C. J., Le Novère, N., Lundberg, J. G., Macklin, J., Mast, A. R., Midford, P. E., Mikó, I., Mungall, C. J., Oellrich, A., Osumi-Sutherland, D., Parkinson, H., Ramírez, M. J., Richter, S., Robinson, P. N., Ruttenberg, A., Schulz, K. S., Segerdell, E., Seltmann, K. C., Sharkey, M. J., Smith, A. D., Smith, B., Specht, C. D., Squires, R. B., Thacker, R. W., Thessen, A., Fernandez-Triana, J., Mauno Vihinen, Vize, P. D., Vogt, L., Wall, C. E., Walls, R. L., Westerfeld, M., Wharton, R. A., Wirkner, C. S., Woolley, J. B., Yoder, M. J., Zorn, A. M. & Mabee, P., 2015, I : PLoS Biology. 13, 1, e1002033.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  35. Genetic Variation in Bruton Tyrosine Kinase

    Gerard C. P. Schaafsma & Mauno Vihinen, 2015, Agammaglobulinemia. Plebani, A. & Lougaris, V. (red.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 75-85 11 s.

    Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceedingKapitel samlingsverk

  36. Harmful somatic amino acid substitutions affect key pathways in cancers.

    Abhishek Niroula & Mauno Vihinen, 2015, I : BMC Medical Genomics. 8, 1, 53.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  37. Muddled genetic terms miss and mess the message.

    Mauno Vihinen, 2015, I : Trends in Genetics. 31, 8, s. 423-425

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragDebate/Note/Editorial

  38. No more hidden solutions in bioinformatics.

    Mauno Vihinen, 2015, I : Nature. 521, 7552, s. 261-261

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragDebate/Note/Editorial

  39. PON-P2: Prediction Method for Fast and Reliable Identification of Harmful Variants.

    Abhishek Niroula, Urolagin, S. & Mauno Vihinen, 2015, I : PLoS ONE. 10, 2, e0117380.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  40. Specific autoantibody profiles and disease subgroups correlate with circulating micro-RNA in systemic sclerosis.

    Dirk Wuttge, Carlsen, A. L., Teku, G., Steen, S. O., Marie Wildt, Mauno Vihinen, Roger Hesselstrand & Heegaard, N. H. H., 2015, I : Rheumatology. 54, 11, s. 2100-2107

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  41. Standard development at the Human Variome Project.

    Smith, T. D. & Mauno Vihinen, 2015, I : Database: the Journal of Biological Databases and Curation. 2015, s. bav024

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  42. The importance of proper testing of predictor performance.

    Mauno Vihinen, 2015, I : Human Mutation. 36, 5, s. iii-iiv

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  43. Types and effects of protein variations.

    Mauno Vihinen, 2015, I : Human Genetics. 134, 4, s. 405-421

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  44. Varisnp, A Benchmark Database For Variations from dbSNP.

    Gerard Schaafsma & Mauno Vihinen, 2015, I : Human Mutation. 36, 2, s. 161-166

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  45. 2014
  46. Clustering of gene ontology terms in genomes.

    Tiirikka, T., Siermala, M. & Mauno Vihinen, 2014, I : Gene. 550, 2, s. 155-164

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  47. Contribution of pseudogenes to sequence diversity.

    Mauno Vihinen, 2014, Pseudogenes. Functions and Protocols.. Poliseno, L. (red.). Springer, s. 15-24

    Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceedingKapitel samlingsverk

  48. Identification of core T cell network based on immunome interactome.

    Teku, G., Ortutay, C. & Mauno Vihinen, 2014, I : BMC Systems Biology. 8, 1, 17.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  49. Majority Vote and Other Problems when using Computational Tools.

    Mauno Vihinen, 2014, I : Human Mutation. 35, 8, s. 912-914

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  50. Novel Association of Neurofibromatosis Type 1-Causing Mutations in Families With Neurofibromatosis-Noonan Syndrome

    Ekvall, S., Sjors, K., Jonzon, A., Mauno Vihinen, Anneren, G. & Bondeson, M-L., 2014, I : American Journal of Medical Genetics. Part A. 164, 3, s. 579-587

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  51. Performance of Protein Disorder Prediction Programs on Amino Acid Substitutions

    Ali, H., Urolagin, S., Gurarslan, O. & Mauno Vihinen, 2014, I : Human Mutation. 35, 7, s. 794-804

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikel

  52. Proper reporting of predictor performance.

    Mauno Vihinen, 2014, I : Nature Methods. 11, 8, s. 781-781

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragLetter

  53. Variation ontology: annotator guide.

    Mauno Vihinen, 2014, I : Journal of Biomedical Semantics. 5, 1, 9.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  54. 2013
  55. Abnormal cerebellar development and ataxia in CARP VIII morphant zebrafish

    Aspatwar, A., Tolvanen, M. E. E., Jokitalo, E., Parikka, M., Ortutay, C., Harjula, S-K. E., Ramet, M., Mauno Vihinen & Parkkila, S., 2013, I : Human Molecular Genetics. 22, 3, s. 417-432

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  56. Copy Number Variation Analysis in Familial BRCA1/2-Negative Finnish Breast and Ovarian Cancer

    Kuusisto, K. M., Akinrinade, O., Mauno Vihinen, Kankuri-Tammilehto, M., Laasanen, S-L. & Schleutker, J., 2013, I : PLoS ONE. 8, 8, e71802.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

Föregående 1 2 3 4 5 6 Nästa