Tobias Ambjörnsson

Universitetslektor, M.Sc.
Fler filtreringsmöjligheter
  1. A fast and scalable kymograph alignment algorithm for nanochannel-based optical DNA mappings.

    Noble, C., Adam Nilsson, Freitag, C., Jason Beech, Jonas Tegenfeldt & Tobias Ambjörnsson, 2015, I : PLoS ONE. 10, 4, e0121905.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  2. Ageing single file motion

    Metzler, R., Sanders, L., Lomholt, M. A., Lizana, L., Fogelmark, K. & Tobias Ambjörnsson, 2014, I : The European Physical Journal. Special Topics. 223, 14, s. 3287-3293

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  3. Applying a potential across a biomembrane: Electrostatic contribution to the bending rigidity and membrane instability

    Tobias Ambjörnsson, Lomholt, M. A. & Hansen, P. L., 2007, I : Physical Review E. 75, 5, 051916.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  4. A simple method to calculate first-passage time densities with arbitrary initial conditions

    Nyberg, M., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2016 jun 1, I : New Journal of Physics. 18, 6, 063019.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  5. Bacteriophage strain typing by rapid single molecule analysis.

    Grunwald, A., Dahan, M., Giesbertz, A., Adam Nilsson, Nyberg, L. K., Weinhold, E., Tobias Ambjörnsson, Westerlund, F. & Ebenstein, Y., 2015, I : Nucleic Acids Research. 43, 18, s. e117

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  6. Binding dynamics of single-stranded DNA binding proteins to fluctuating bubbles in breathing DNA

    Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2005 maj 25, I : Journal of Physics: Condensed Matter. 17, 20, s. S1841-S1869

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  7. Blinking statistics of a molecular beacon triggered by end-denaturation of DNA

    Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2005 dec 14, I : Journal of Physics: Condensed Matter. 17, 49, s. S4305-S4316

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  8. Breathing Dynamics in Heteropolymer DNA

    Tobias Ambjörnsson, Banik, S. K., Krichevsky, O. & Metzler, R., 2007 apr 15, I : Biophysical Journal. 92, 8, s. 2674-2684

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  9. Bubble coalescence in breathing DNA: Two vicious walkers in opposite potentials

    Novotny, T., Pedersen, J., T. Ambjörnsson, Hansen, M. S. & Metzler, R., 2007, I : Europhysics Letters. 77, 4, 48001.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  10. Bubble merging in breathing DNA as a vicious walker problem in opposite potentials.

    Pedersen, J., Hansen, M. S., Novotný, T., Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2009, I : Journal of Chemical Physics. 130, 16, 164117.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  11. Chaperone-assisted translocation

    Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2004 jun 1, I : Physical Biology. 1, 2, s. 77-88

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  12. Charged polymer membrane translocation

    T. Ambjörnsson, Apell, S. P., Konkoli, Z., Di Marzio, E. A. & Kasianowicz, J. J., 2002 aug 22, I : The Journal of chemical physics. 117, 8, s. 4063-4073

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  13. Competitive binding-based optical DNA mapping for fast identification of bacteria - multi-ligand transfer matrix theory and experimental applications on Escherichia coli.

    Adam Nilsson, Emilsson, G., Nyberg, L. K., Noble, C., Svensson Stadler, L., Fritzsche, J., Moore, E. R. B., Jonas Tegenfeldt, Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2014, I : Nucleic Acids Research. 42, 15, s. e118

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  14. Coupled dynamics of DNA breathing and of proteins that selectively bind to single-stranded DNA

    Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2005, I : Physical Review E. 72, 3

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  15. Detailed characterization of plasmids carrying resistance genes using optical DNA mapping

    Müller, V., Nyberg, L. K., Quaderi, S., Kristiansson, E., Tobias Ambjörnsson, Sandegren, L. & Westerlund, F., 2016, 20th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2016. Chemical and Biological Microsystems Society, s. 1561-1562 2 s.

    Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceedingKonferenspaper i proceeding

  16. Diffusion of two particles with a finite interaction potential in one dimension

    Tobias Ambjörnsson & Silbey, R. J., 2008 okt 28, I : The Journal of chemical physics. 129, 16, s. 165103

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  17. Dipolar response of an ellipsoidal particle with an anisotropic coating

    T Ambjörnsson & Mukhopadhyay, G., 2003 okt 24, I : Journal of Physics A: Mathematical and General. 36, 42, s. 10651-10665

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  18. Directed motion emerging from two coupled random processes: translocation of a chain through a membrane nanopore driven by binding proteins

    Tobias Ambjörnsson, Lomholt, M. A. & Metzler, R., 2005 nov 30, I : Journal of Physics: Condensed Matter. 17, 47, s. S3945-S3964

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  19. Direct identification of antibiotic resistance genes on single plasmid molecules using CRISPR/Cas9 in combination with optical DNA mapping

    Müller, V., Rajer, F., Frykholm, K., Nyberg, L. K., Quaderi, S., Fritzsche, J., Kristiansson, E., Tobias Ambjörnsson, Sandegren, L. & Westerlund, F., 2016 dec 1, I : Scientific Reports. 6, 37938.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  20. Dissimilar bouncy walkers

    Lomholt, M. A., Lizana, L. & Tobias Ambjörnsson, 2011, I : Journal of Chemical Physics. 134, 4, 045101.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  21. Dynamic Approach to DNA Breathing

    Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2005 dec 1, I : Journal of Biological Physics. 31, 3-4, s. 339-350

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  22. Electromagnetic response of a dipole-coupled ellipsoidal bilayer

    T. Ambjörnsson, Apell, S. P. & Mukhopadhyay, G., 2004, I : Physical Review E. 69, 3, 031914.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  23. Ellipsoidal particles driven by intensity gradients through viscous fluids

    T. Ambjörnsson & Apell, S. P., 2003, I : Physical Review E. 67, 3, 031917.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  24. Enzyme-free optical DNA mapping of the human genome using competitive binding

    Müller, V., Albertas Dvirnas, Andersson, J., Singh, V., Kk, S., Johansson, P., Ebenstein, Y., Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2019 sep 5, I : Nucleic Acids Research. 47, 15, e89.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  25. Extension of nanoconfined DNA: Quantitative comparison between experiment and theory

    Iarko, V., Werner, E., Nyberg, L. K., Muller, V., Fritzsche, J., Tobias Ambjörnsson, Jason Beech, Jonas Tegenfeldt, Mehlig, K., Westerlund, F. & Mehlig, B., 2015, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 6, 062701.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  26. Facilitated sequence assembly using densely labeled optical DNA barcodes: A combinatorial auction approach

    Albertas Dvirnas, Christoffer Pichler, Stewart, C. L., Quaderi, S., Nyberg, L. K., Müller, V., Bikkarolla, S. K., Kristiansson, E., Sandegren, L., Westerlund, F. & Tobias Ambjörnsson, 2018 mar 1, I : PLoS ONE. 13, 3, e0193900.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  27. Fast size-determination of intact bacterial plasmids using nanofluidic channels

    Frykholm, K., Nyberg, L. K., Lagerstedt, E., Noble, C., Fritzsche, J., Karami, N., Tobias Ambjörnsson, Sandegren, L. & Westerlund, F., 2015, I : Lab on a Chip. 15, 13, s. 2739-2743

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  28. First passage times for a tracer particle in single file diffusion and fractional Brownian motion.

    Sanders, L. & Tobias Ambjörnsson, 2012, I : Journal of Chemical Physics. 136, 17, 175103.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  29. Fitting a function to time-dependent ensemble averaged data

    Fogelmark, K., Lomholt, M. A., Anders Irbäck & Tobias Ambjörnsson, 2018 dec 1, I : Scientific Reports. 8, 1, 6984.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  30. Foundation of fractional Langevin equation: Harmonization of a many-body problem

    Lizana, L., Tobias Ambjörnsson, Taloni, A., Barkai, E. & Lomholt, M. A., 2010, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 81, 5

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  31. How nanochannel confinement affects the DNA melting transition within the Poland-Scheraga model.

    Reiter-Schad, M., Werner, E., Jonas Tegenfeldt, Mehlig, B. & Tobias Ambjörnsson, 2015, I : Journal of Chemical Physics. 143, 11, 115101.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  32. Identifying bacteria using DNA binding maps

    Emilsson, G., Adam Nilsson, Nyberg, L. K., Noble, C., Svensson Stadler, L., Moore, E. R. B., Tobias Ambjörnsson, Jonas O. Tegenfeldt & Westerlund, F., 2013 jan 1, 17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2013. Chemical and Biological Microsystems Society, Vol. 1. s. 473-475 3 s.

    Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceedingKonferenspaper i proceeding

  33. Many-body effects on tracer particle diffusion with applications for single-protein dynamics on DNA

    Ahlberg, S., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2015, I : New Journal of Physics. 17, 043036.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  34. Master equation approach to DNA breathing in heteropolymer DNA

    Tobias Ambjörnsson, Banik, S. K., Lomholt, M. A. & Metzler, R., 2007, I : Physical Review E. 75, 2, 021908.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  35. Microscopic Origin of the Logarithmic Time Evolution of Aging Processes in Complex Systems

    Lomholt, M. A., Lizana, L., Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2013, I : Physical Review Letters. 110, 20, 208301.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  36. Model for melting of confined DNA

    Werner, E., Reiter-Schad, M., Tobias Ambjörnsson & Mehlig, B., 2015, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 91, 6, 060702.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  37. Nanoconfined Circular and Linear DNA: Equilibrium Conformations and Unfolding Kinetics

    Alizadehheidari, M., Werner, E., Noble, C., Reiter-Schad, M., Nyberg, L. K., Fritzsche, J., Mehlig, B., Jonas Tegenfeldt, Tobias Ambjörnsson, Persson, F. & Westerlund, F., 2015, I : Macromolecules. 48, 3, s. 871-878

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  38. Nanoconfined circular DNA

    Alizadehheidari, M., Werner, E., Noble, C., Nyberg, L. K., Fritzsche, J., Persson, F., Mehlig, B., J. O. Tegenfeldt, T. Ambjörnsson & Westerlund, F., 2014, 18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2014. Chemical and Biological Microsystems Society, s. 1353-1355 3 s.

    Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceedingKonferenspaper i proceeding

  39. Nature of polarized excitons

    T. Ambjörnsson & Apell, S. P., 2001 feb 22, I : The Journal of chemical physics. 114, 8, s. 3365-3372

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  40. Noise reduction in single time frame optical DNA maps

    Torche Pedreschi, P. C., Müller, V., Westerlund, F. & Tobias Ambjörnsson, 2017 jun 1, I : PLoS ONE. 12, 6, e0179041.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  41. Non-Markovian effects in the first-passage dynamics of obstructed tracer particle diffusion in one-dimensional systems.

    Forsling, R., Sanders, L., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2014, I : Journal of Chemical Physics. 141, 9, 094902.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  42. Observing Plasmonic-Molecular Resonance Coupling on Single Gold Nanorods

    Ni, W., Tobias Ambjörnsson, Apell, S. P., Chen, H. & Wang, J., 2010, I : Nano Letters. 10, 1, s. 77-84

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  43. Optical DNA Mapping Combined with Cas9-Targeted Resistance Gene Identification for Rapid Tracking of Resistance Plasmids in a Neonatal Intensive Care Unit Outbreak

    Bikkarolla, S. K., Nordberg, V., Rajer, F., Müller, V., Kabir, M. H., Kk, S., Albertas Dvirnas, Tobias Ambjörnsson, Giske, C. G., Navér, L., Sandegren, L. & Westerlund, F., 2019 jul 9, I : mBio. 10, 4, e00347-19.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  44. Optimal Target Search on a Fast-Folding Polymer Chain with Volume Exchange

    Lomholt, M. A., Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2005, I : Physical Review Letters. 95, 26, 260603.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  45. Perturbative solution to susceptible-infected-susceptible epidemics on networks.

    Sanders, L., Bo Söderberg, Brockmann, D. & Tobias Ambjörnsson, 2013, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 88, 3, 032713.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  46. Rapid identification of intact bacterial resistance plasmids via optical mapping of single DNA molecules

    Nyberg, L. K., Quaderi, S., Emilsson, G., Karami, N., Lagerstedt, E., Müller, V., Noble, C., Hammarberg, S., Adam N. Nilsson, Sjöberg, F., Fritzsche, J., Kristiansson, E., Sandegren, L., Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2016 jul 27, I : Scientific Reports. 6, 30410.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  47. Rapid tracing of resistance plasmids in a nosocomial outbreak using optical DNA mapping

    Müller, V., Karami, N., Nyberg, L. K., Christoffer Pichler, Torche Pedreschi, P. C., Quaderi, S., Fritzsche, J., Tobias Ambjörnsson, Åhrén, C. & Westerlund, F., 2016 maj 13, I : ACS Infectious Diseases. 2, 5, s. 322-328 7 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  48. Resonant coupling between localized plasmons and anisotropic molecular coatings in ellipsoidal metal nanoparticles

    Tobias Ambjörnsson, Mukhopadhyay, G., Apell, S. P. & Käll, M., 2006, I : Physical Review B. 73, 8

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  49. Sensing DNA–DNA as Nanosensor: A Perspective Towards Nanobiotechnology

    Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2005 sep 1, I : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 2, 3, s. 389-395

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

Föregående 1 2 Nästa