Tobias Ambjörnsson

Universitetslektor, M.Sc.
Fler filtreringsmöjligheter
  1. Artikel i vetenskaplig tidskrift
  2. Enzyme-free optical DNA mapping of the human genome using competitive binding

    Müller, V., Albertas Dvirnas, Andersson, J., Singh, V., Kk, S., Johansson, P., Ebenstein, Y., Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2019 sep 5, I : Nucleic Acids Research. 47, 15, e89.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  3. Optical DNA Mapping Combined with Cas9-Targeted Resistance Gene Identification for Rapid Tracking of Resistance Plasmids in a Neonatal Intensive Care Unit Outbreak

    Bikkarolla, S. K., Nordberg, V., Rajer, F., Müller, V., Kabir, M. H., Kk, S., Albertas Dvirnas, Tobias Ambjörnsson, Giske, C. G., Navér, L., Sandegren, L. & Westerlund, F., 2019 jul 9, I : mBio. 10, 4, e00347-19.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  4. Fitting a function to time-dependent ensemble averaged data

    Fogelmark, K., Lomholt, M. A., Anders Irbäck & Tobias Ambjörnsson, 2018 dec 1, I : Scientific Reports. 8, 1, 6984.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  5. The resistomes of six carbapenem-resistant pathogens - a critical genotype-phenotype analysis

    Johnning, A., Karami, N., Tång Hallbäck, E., Müller, V., Nyberg, L., Buongermino Pereira, M., Stewart, C., Tobias Ambjörnsson, Westerlund, F., Adlerberth, I. & Kristiansson, E., 2018 nov, I : Microbial Genomics. 4, 11

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  6. Zero-crossing statistics for non-Markovian time series

    Nyberg, M., Lizana, L. & Tobias Ambjörnsson, 2018 mar 14, I : Physical Review E. 97, 3, 032114.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  7. Facilitated sequence assembly using densely labeled optical DNA barcodes: A combinatorial auction approach

    Albertas Dvirnas, Christoffer Pichler, Stewart, C. L., Quaderi, S., Nyberg, L. K., Müller, V., Bikkarolla, S. K., Kristiansson, E., Sandegren, L., Westerlund, F. & Tobias Ambjörnsson, 2018 mar 1, I : PLoS ONE. 13, 3, e0193900.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  8. Stochastic unfolding of nanoconfined DNA: Experiments, model and Bayesian analysis

    Jens Krog, Alizadehheidari, M., Werner, E., Bikkarolla, S. K., Jonas O. Tegenfeldt, Mehlig, B., Lomholt, M. A., Westerlund, F. & Tobias Ambjörnsson, 2018, I : Journal of Chemical Physics. 149, 21, 215101.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  9. Tracer particle diffusion in a system with hardcore interacting particles

    Pigeon, S., Fogelmark, K., Bo Söderberg, Mukhopadhyay, G. & Tobias Ambjörnsson, 2017 dec 21, I : Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2017, 12, 123209.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  10. Noise reduction in single time frame optical DNA maps

    Torche Pedreschi, P. C., Müller, V., Westerlund, F. & Tobias Ambjörnsson, 2017 jun 1, I : PLoS ONE. 12, 6, e0179041.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  11. Tracer particles in two-dimensional elastic networks diffuse logarithmically slow

    Lizana, L., Tobias Ambjörnsson & Lomholt, M. A., 2017 jan 20, I : Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical. 50, 3, 034001.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  12. Direct identification of antibiotic resistance genes on single plasmid molecules using CRISPR/Cas9 in combination with optical DNA mapping

    Müller, V., Rajer, F., Frykholm, K., Nyberg, L. K., Quaderi, S., Fritzsche, J., Kristiansson, E., Tobias Ambjörnsson, Sandegren, L. & Westerlund, F., 2016 dec 1, I : Scientific Reports. 6, 37938.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  13. Super-Resolution Genome Mapping in Silicon Nanochannels

    Jeffet, J., Kobo, A., Su, T., Grunwald, A., Green, O., Adam Kinos, Eisenberg, E., Tobias Ambjörnsson, Westerlund, F., Weinhold, E., Shabat, D., Purohit, P. K. & Ebenstein, Y., 2016 nov 22, I : ACS Nano. 10, 11, s. 9823-9830 8 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  14. Rapid identification of intact bacterial resistance plasmids via optical mapping of single DNA molecules

    Nyberg, L. K., Quaderi, S., Emilsson, G., Karami, N., Lagerstedt, E., Müller, V., Noble, C., Hammarberg, S., Adam N. Nilsson, Sjöberg, F., Fritzsche, J., Kristiansson, E., Sandegren, L., Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2016 jul 27, I : Scientific Reports. 6, 30410.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  15. A simple method to calculate first-passage time densities with arbitrary initial conditions

    Nyberg, M., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2016 jun 1, I : New Journal of Physics. 18, 6, 063019.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  16. Rapid tracing of resistance plasmids in a nosocomial outbreak using optical DNA mapping

    Müller, V., Karami, N., Nyberg, L. K., Christoffer Pichler, Torche Pedreschi, P. C., Quaderi, S., Fritzsche, J., Tobias Ambjörnsson, Åhrén, C. & Westerlund, F., 2016 maj 13, I : ACS Infectious Diseases. 2, 5, s. 322-328 7 s.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  17. Bacteriophage strain typing by rapid single molecule analysis.

    Grunwald, A., Dahan, M., Giesbertz, A., Adam Nilsson, Nyberg, L. K., Weinhold, E., Tobias Ambjörnsson, Westerlund, F. & Ebenstein, Y., 2015, I : Nucleic Acids Research. 43, 18, s. e117

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  18. Fast size-determination of intact bacterial plasmids using nanofluidic channels

    Frykholm, K., Nyberg, L. K., Lagerstedt, E., Noble, C., Fritzsche, J., Karami, N., Tobias Ambjörnsson, Sandegren, L. & Westerlund, F., 2015, I : Lab on a Chip. 15, 13, s. 2739-2743

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  19. How nanochannel confinement affects the DNA melting transition within the Poland-Scheraga model.

    Reiter-Schad, M., Werner, E., Jonas Tegenfeldt, Mehlig, B. & Tobias Ambjörnsson, 2015, I : Journal of Chemical Physics. 143, 11, 115101.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  20. Extension of nanoconfined DNA: Quantitative comparison between experiment and theory

    Iarko, V., Werner, E., Nyberg, L. K., Muller, V., Fritzsche, J., Tobias Ambjörnsson, Jason Beech, Jonas Tegenfeldt, Mehlig, K., Westerlund, F. & Mehlig, B., 2015, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 6, 062701.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  21. Model for melting of confined DNA

    Werner, E., Reiter-Schad, M., Tobias Ambjörnsson & Mehlig, B., 2015, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 91, 6, 060702.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  22. Nanoconfined Circular and Linear DNA: Equilibrium Conformations and Unfolding Kinetics

    Alizadehheidari, M., Werner, E., Noble, C., Reiter-Schad, M., Nyberg, L. K., Fritzsche, J., Mehlig, B., Jonas Tegenfeldt, Tobias Ambjörnsson, Persson, F. & Westerlund, F., 2015, I : Macromolecules. 48, 3, s. 871-878

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  23. A fast and scalable kymograph alignment algorithm for nanochannel-based optical DNA mappings.

    Noble, C., Adam Nilsson, Freitag, C., Jason Beech, Jonas Tegenfeldt & Tobias Ambjörnsson, 2015, I : PLoS ONE. 10, 4, e0121905.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  24. Visualizing the entire DNA from a chromosome in a single frame

    Freitag, C., Noble, C., Fritzsche, J., Persson, F., Reiter-Schad, M., Adam Nilsson, Graneli, A., Tobias Ambjörnsson, Mir, K. U. & Jonas Tegenfeldt, 2015, I : Biomicrofluidics. 9, 4, 044114.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  25. Many-body effects on tracer particle diffusion with applications for single-protein dynamics on DNA

    Ahlberg, S., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2015, I : New Journal of Physics. 17, 043036.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  26. Competitive binding-based optical DNA mapping for fast identification of bacteria - multi-ligand transfer matrix theory and experimental applications on Escherichia coli.

    Adam Nilsson, Emilsson, G., Nyberg, L. K., Noble, C., Svensson Stadler, L., Fritzsche, J., Moore, E. R. B., Jonas Tegenfeldt, Tobias Ambjörnsson & Westerlund, F., 2014, I : Nucleic Acids Research. 42, 15, s. e118

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  27. Non-Markovian effects in the first-passage dynamics of obstructed tracer particle diffusion in one-dimensional systems.

    Forsling, R., Sanders, L., Tobias Ambjörnsson & Lizana, L., 2014, I : Journal of Chemical Physics. 141, 9, 094902.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  28. Single-file diffusion with non-thermal initial conditions

    Lizana, L., Lomholt, M. A. & Tobias Ambjörnsson, 2014, I : Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 395, s. 148-153

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  29. Severe slowing-down and universality of the dynamics in disordered interacting many-body systems: ageing and ultraslow diffusion

    Sanders, L., Lomholt, M. A., Lizana, L., Fogelmark, K., Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2014, I : New Journal of Physics. 16, 113050.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  30. Ageing single file motion

    Metzler, R., Sanders, L., Lomholt, M. A., Lizana, L., Fogelmark, K. & Tobias Ambjörnsson, 2014, I : The European Physical Journal. Special Topics. 223, 14, s. 3287-3293

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  31. Perturbative solution to susceptible-infected-susceptible epidemics on networks.

    Sanders, L., Bo Söderberg, Brockmann, D. & Tobias Ambjörnsson, 2013, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 88, 3, 032713.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  32. Microscopic Origin of the Logarithmic Time Evolution of Aging Processes in Complex Systems

    Lomholt, M. A., Lizana, L., Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2013, I : Physical Review Letters. 110, 20, 208301.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  33. First passage times for a tracer particle in single file diffusion and fractional Brownian motion.

    Sanders, L. & Tobias Ambjörnsson, 2012, I : Journal of Chemical Physics. 136, 17, 175103.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  34. Dissimilar bouncy walkers

    Lomholt, M. A., Lizana, L. & Tobias Ambjörnsson, 2011, I : Journal of Chemical Physics. 134, 4, 045101.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  35. Foundation of fractional Langevin equation: Harmonization of a many-body problem

    Lizana, L., Tobias Ambjörnsson, Taloni, A., Barkai, E. & Lomholt, M. A., 2010, I : Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 81, 5

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  36. Observing Plasmonic-Molecular Resonance Coupling on Single Gold Nanorods

    Ni, W., Tobias Ambjörnsson, Apell, S. P., Chen, H. & Wang, J., 2010, I : Nano Letters. 10, 1, s. 77-84

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  37. Single DNA denaturation and bubble dynamics

    Metzler, R., Tobias Ambjörnsson, Hanke, A. & Fogedby, H. C., 2009 jan 21, I : Journal of Physics: Condensed Matter. 21, 3, 034111.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  38. Bubble merging in breathing DNA as a vicious walker problem in opposite potentials.

    Pedersen, J., Hansen, M. S., Novotný, T., Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2009, I : Journal of Chemical Physics. 130, 16, 164117.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  39. Single-file dynamics with different diffusion constants

    Tobias Ambjörnsson, Lizana, L., Lomholt, M. A. & Silbey, R. J., 2008 nov 14, I : The Journal of chemical physics. 129, 18, 185106.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  40. Diffusion of two particles with a finite interaction potential in one dimension

    Tobias Ambjörnsson & Silbey, R. J., 2008 okt 28, I : The Journal of chemical physics. 129, 16, s. 165103

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  41. Single-File Diffusion in a Box

    Lizana, L. & T. Ambjörnsson, 2008, I : Physical Review Letters. 100, 20, 200601.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  42. Breathing Dynamics in Heteropolymer DNA

    Tobias Ambjörnsson, Banik, S. K., Krichevsky, O. & Metzler, R., 2007 apr 15, I : Biophysical Journal. 92, 8, s. 2674-2684

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  43. Bubble coalescence in breathing DNA: Two vicious walkers in opposite potentials

    Novotny, T., Pedersen, J., T. Ambjörnsson, Hansen, M. S. & Metzler, R., 2007, I : Europhysics Letters. 77, 4, 48001.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  44. Applying a potential across a biomembrane: Electrostatic contribution to the bending rigidity and membrane instability

    Tobias Ambjörnsson, Lomholt, M. A. & Hansen, P. L., 2007, I : Physical Review E. 75, 5, 051916.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  45. Master equation approach to DNA breathing in heteropolymer DNA

    Tobias Ambjörnsson, Banik, S. K., Lomholt, M. A. & Metzler, R., 2007, I : Physical Review E. 75, 2, 021908.

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  46. Sequence Sensitivity of Breathing Dynamics in Heteropolymer DNA

    Tobias Ambjörnsson, Banik, S. K., Krichevsky, O. & Metzler, R., 2006, I : Physical Review Letters. 97, 12

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  47. Resonant coupling between localized plasmons and anisotropic molecular coatings in ellipsoidal metal nanoparticles

    Tobias Ambjörnsson, Mukhopadhyay, G., Apell, S. P. & Käll, M., 2006, I : Physical Review B. 73, 8

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  48. Blinking statistics of a molecular beacon triggered by end-denaturation of DNA

    Tobias Ambjörnsson & Metzler, R., 2005 dec 14, I : Journal of Physics: Condensed Matter. 17, 49, s. S4305-S4316

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

  49. Dynamic Approach to DNA Breathing

    Metzler, R. & Tobias Ambjörnsson, 2005 dec 1, I : Journal of Biological Physics. 31, 3-4, s. 339-350

    Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikel i vetenskaplig tidskrift

Föregående 1 2 Nästa