Beräkningskemi

2025

Photophysics and photochemistry of a d⁵ Ruthenium complex

Tran Hoang Hai, Y., 2025 maj 15, Lund. 115 s.

Forskningsoutput: Avhandling › Licentiatavhandling

Exceptionally Strong Double-Layer Barriers Generated by Polyampholyte Salt

Ribar, D., Woodward, C. E. & Forsman, J., 2025 apr. 3, I: Journal of Physical Chemistry B. 129, 17, s. 4241-4248 8 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Assessing the interaction between the N-terminal region of the membrane protein magnesium transporter A and a lipid bilayer

Skog, A. E., Jones, N. C., Månsson, L. K., Morth, J. P., Vrønning Hoffmann, S., Gerelli, Y. & Skepö, M., 2025 apr., I: Journal of Colloid and Interface Science. 683, s. 663-674 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Embedded cluster approach for accurate electronic structure calculations of ²²⁹Th :CaF₂

Nalikowski, K., Veryazov, V., Beeks, K., Schumm, T. & Krośnicki, M., 2025 mars 15, I: Physical Review B. 111, 11, 115103.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Characterization of rapeseed protein supramolecular structures obtained by aqueous extractions

Alpiger, S. B., Smith, G. N., Pedersen, J. S., Moeller, T. L., Soerensen, H. V. & Corredig, M., 2025 mars, I: Food Hydrocolloids. 160, 110770.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Coherent photoproduction of light vector mesons off nuclear targets in the dipole picture

Henkels, C., de Oliveira, E. G., Pasechnik, R. & Trebien, H., 2025 mars, I: Nuclear Physics A. 1055, 123018.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Impact of Varying Velocities and Solvation Boxes on Alchemical Free-Energy Simulations

Wang, M., Jiang, H. & Ryde, U., 2025 jan. 31, (E-pub ahead of print) I: Journal of Chemical Information and Modeling.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

The Cu_B site in particulate methane monooxygenase may be used to produce hydrogen peroxide

Lundgren, K. J. M., Cao, L., Torbjörnsson, M., Hedegård, E. D. & Ryde, U., 2025 jan. 16, I: Dalton Transactions. 54, 8, s. 3141-3156 16 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Lysozyme revisited

Oksanen, E., 2025 jan., I: Structure. 33, 1, s. 6-7 2 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Debate/Note/Editorial › Peer review

Strong electrostatic attraction drives milk heteroprotein complex coacervation

Vinterbladh, I., Soussi, R. H., Forsman, J., Bouhallab, S. & Lund, M., 2025 jan., I: International Journal of Biological Macromolecules. 286, 137790.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2024

Enhanced diffusion through multivalency

Bartoš, L., Lund, M. & Vacha, R., 2024 dec., I: Soft Matter. 21, 2, s. 179-185 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Exploring the factors influencing the ketoenamine-enolimine tautomeric equilibrium of pyridoxal 5′-phosphate in branched-chain aminotransferases

Li, X., Yu, H., Sun, J. & Sun, X., 2024 dec., I: Molecular Catalysis. 569, 114581.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

The winter holidays are glorious-except when they're not

Kamerlin, S. C. L., 2024 dec., I: EMBO Reports. 25, 12, s. 5223-5224 2 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Debate/Note/Editorial

Öppen tillgång

Investigating the Substrate Oxidation Mechanism in Lytic Polysaccharide Monooxygenase: H₂O₂- versus O₂-Activation

Hagemann, M. M., Wieduwilt, E. K., Ryde, U. & Hedegård, E. D., 2024 nov. 18, I: Inorganic Chemistry. 63, 46, s. 21929-21940 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Quantum refinement in real and reciprocal space using the Phenix and ORCA software

Lundgren, K. J. M., Caldararu, O., Oksanen, E. & Ryde, U., 2024 nov. 1, I: IUCrJ. 11, Pt 6, s. 921-937 17 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

QM/MM Studies of Nitrogenase

Jiang, H., 2024 sep. 27, Lund: Lund University (Media-Tryck). 225 s.

Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling (sammanläggning)

Fil

338 Nedladdningar (Pure)

Anisotropic coarse-grain Monte Carlo simulations of lysozyme, lactoferrin, and NISTmAb by precomputing atomistic models

Hatch, H. W., Bergonzo, C., Blanco, M. A., Yuan, G., Grudinin, S., Lund, M., Curtis, J. E., Grishaev, A. V., Liu, Y. & Shen, V. K., 2024 sep., I: Journal of Chemical Physics. 161, 9, 094113.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Rubus wahlbergii and related species in Sweden

Zhou, M., Montes, M. S., Mattsson, T., Burén, T., Hedrén, M. & Ryde, U., 2024 sep., I: Nordic Journal of Botany. 2024, 9, e04373.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Cluster Formation Induced by Local Dielectric Saturation in Restricted Primitive Model Electrolytes

Ribar, D., Woodward, C. E., Nordholm, S. & Forsman, J., 2024 aug. 15, I: The Journal of Physical Chemistry Letters. 15, 32, s. 8326-8333 8 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Reaction Mechanism for CO Reduction by Mo-Nitrogenase Studied by QM/MM

Jiang, H. & Ryde, U., 2024 aug. 14, I: Inorganic Chemistry. 63, 34, s. 15951–15963 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Deeper Insight of the Conformational Ensemble of Intrinsically Disordered Proteins

Svensson, O., Bakker, M. J. & Skepö, M., 2024 aug., I: Journal of Chemical Information and Modeling. 64, 15, s. 6105-6114 10 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Translocation of Antimicrobial Peptides across Model Membranes: The Role of Peptide Chain Length

Skog, A. E., Paracini, N., Gerelli, Y. & Skepö, M., 2024 aug., I: Molecular Pharmaceutics. 21, 8, s. 4082-4097 16 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Using Iron L-Edge and Nitrogen K-Edge X-ray Absorption Spectroscopy to Improve the Understanding of the Electronic Structure of Iron Carbene Complexes

Guo, M., Temperton, R., D’Acunto, G., Johansson, N., Jones, R., Handrup, K., Ringelband, S., Prakash, O., Fan, H., de Groot, L. H. M., Hlynsson, V. F., Kaufhold, S., Gordivska, O., Velásquez González, N., Wärnmark, K., Schnadt, J., Persson, P. & Uhlig, J., 2024 juli 8, I: Inorganic Chemistry. 63, 27, s. 12457-12468 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

CO Oxidation Mechanism of Silver-Substituted Mo/Cu CO-Dehydrogenase – Analogies and Differences to the Native Enzyme

Rovaletti, A., Moro, G., Cosentino, U., Ryde, U. & Greco, C., 2024 juli 2, I: ChemPhysChem. 25, 13, e202400293.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Exploring the Functional Landscape of the p53 Regulatory Domain: The Stabilizing Role of Post-Translational Modifications

Bakker, M. J., Svensson, O., So̷rensen, H. V. & Skepö, M., 2024 juli, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 20, 14, s. 5842-5853 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Strong-coupling effective-field theory for asymmetrically charged plates with counterions only

Šamaj, L., Trizac, E. & Trulsson, M., 2024 juli, I: Physical Review E. 110, 1, 014609.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Putative reaction mechanism of nitrogenase with a half-dissociated S2B ligand

Jiang, H. & Ryde, U., 2024 juni 20, I: Dalton Transactions. 53, 27, s. 11500-11513 14 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Perspective: multi-configurational methods in bio-inorganic chemistry

Jørgensen, F. K., Delcey, M. G. & Hedegård, E. D., 2024 juni 7, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 26, 25, s. 17443-17455 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

Unraveling the Binding Mode of Cyclic Adenosine–Inosine Monophosphate (cAIMP) to STING through Molecular Dynamics Simulations

Wang, M., Fan, B., Lu, W., Ryde, U., Chang, Y., Han, D., Lu, J., Liu, T., Gao, Q., Chen, C. & Xu, Y., 2024 juni, I: Molecules. 29, 11, 2650.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Side-group switching between metal-to-ligand charge-transfer and metal-centered excited state properties in iron(II) N-heterocyclic carbene complexes

Lindh, L., Rosemann, N. W., Losada, I. B., Persson, S., Goriya, Y., Fan, H., Gordivska, O., Wärnmark, K., Uhlig, J., Chábera, P., Yartsev, A. & Persson, P., 2024 maj 1, I: Coordination Chemistry Reviews. 506, 215709.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

Öppen tillgång

Influence of Selective Carbon 1s Excitation on Auger–Meitner Decay in the ESCA Molecule

Fouda, A., Lindblom, V., Southworth, S. H., Doumy, G., Ho, P., Young, L., Cheng, L. & Sorensen, S. L., 2024 apr. 24, I: Journal of Physical Chemistry Letters. 15, 16, s. 4286-4293 8.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Interplay of halogen bonding and solvation in protein-ligand binding

Verteramo, M. L., Ignjatović, M. M., Kumar, R., Wernersson, S., Ekberg, V., Wallerstein, J., Carlström, G., Chadimová, V., Leffler, H., Zetterberg, F., Logan, D. T., Ryde, U., Akke, M. & Nilsson, U. J., 2024 apr. 19, I: iScience. 27, 4, 109636.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

A comprehensive exploration of structural and electronic properties of molybdenum clusters

Wei, Y., Veryazov, V. & Kantorovich, L., 2024 mars 1, I: APL Materials. 12, 3, 031127.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

A multi-scale numerical approach to study monoclonal antibodies in solution

Polimeni, M., Zaccarelli, E., Gulotta, A., Lund, M., Stradner, A. & Schurtenberger, P., 2024 mars 1, I: APL Bioengineering. 8, 1, 016111.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

How Rigidity and Conjugation of Bidentate Ligands Affect the Geometry and Photophysics of Iron N-Heterocyclic Complexes: A Comparative Study

Prakash, O., Chábera, P., Kaul, N., Hlynsson, V. F., Rosemann, N. W., Losada, I. B., Hoang Hai, Y. T., Huang, P., Bendix, J., Ericsson, T., Häggström, L., Gupta, A. K., Strand, D., Yartsev, A., Lomoth, R., Persson, P. & Wärnmark, K., 2024 mars, I: Inorganic Chemistry. 63, 10, s. 4461-4473 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Modeling Photofunctional Transition Metal Complexes

Bolano Losada, I., 2024 mars, Lund, Sweden: Division of Theoretical Chemistry, Department of Chemistry, Lund University. 250 s.

Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling (sammanläggning)

Öppen tillgång

Fil

239 Nedladdningar (Pure)

QM/MM study of the catalytic reaction of aphid myrosinase

Jafari, S., Ryde, U. & Irani, M., 2024 mars, I: International Journal of Biological Macromolecules. 262, 130089.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Fil

1 Nedladdningar (Pure)

Hydrogen bonding in glassy trehalose-water system: Insights from density functional theory and molecular dynamics simulations

Kocherbitov, V., Music, D. & Veryazov, V., 2024 feb. 28, I: Journal of Chemical Physics. 160, 8, 084504.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Scalar Relativistic All-Electron and Pseudopotential Ab Initio Study of a Minimal Nitrogenase [Fe(SH)₄H]⁻ Model Employing Coupled-Cluster and Auxiliary-Field Quantum Monte Carlo Many-Body Methods

Vysotskiy, V. P., Filippi, C. & Ryde, U., 2024 feb. 22, I: Journal of Physical Chemistry A. 128, 7, s. 1358-1374 17 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Photoredox matching of earth-abundant photosensitizers with hydrogen evolving catalysts by first-principles predictions

Losada, I. B. & Persson, P., 2024 feb., I: Journal of Chemical Physics. 160, 7, 074302.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Tailoring the Photophysical Properties of a Homoleptic Iron(II) Tetra N-Heterocyclic Carbene Complex by Attaching an Imidazolium Group to the (C^∧N^∧C) Pincer Ligand─A Comparative Study

Prakash, O., Lindh, L., Gupta, A. K., Hoang Hai, Y. T., Kaul, N., Chábera, P., Lindgren, F., Ericsson, T., Häggström, L., Strand, D., Yartsev, A., Lomoth, R., Persson, P. & Wärnmark, K., 2024 feb., I: Inorganic Chemistry. 63, 6, s. 2909-2918 10 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Variational Pair-Density Functional Theory: Dealing with Strong Correlation at the Protein Scale

Scott, M., Rodrigues, G. L. S., Li, X. & Delcey, M. G., 2024 jan. 13, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 20, 6

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Time-resolved scattering methods for biological samples at the CoSAXS beamline, MAX IV Laboratory

Herranz-Trillo, F., Sørensen, H. V., Dicko, C., Pérez, J., Lenton, S., Foderà, V., Fornell, A., Skepö, M., Plivelic, T. S., Berntsson, O., Andersson, M., Magkakis, K., Orädd, F., Ahn, B., Appio, R., Da Silva, J., Da Silva, V., Lerato, M. & Terry, A. E., 2024 jan., Time-Resolved Methods in Structural Biology. Academic Press, s. 245-296 52 s. (Methods in Enzymology; vol. 709).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceeding › Kapitel samlingsverk › Forskning › Peer review

An efficient method to establish electrostatic screening lengths of restricted primitive model electrolytes

Forsman, J., Ribar, D. & Woodward, C. E., 2024, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 26, 29, s. 19921-19933 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Convergence criteria for single-step free-energy calculations: the relation between the Π bias measure and the sample variance

Wang, M., Mei, Y. & Ryde, U., 2024, I: Chemical Science. 15, 23, s. 8786-8799 14 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Exploring the Role of Globular Domain Locations on an Intrinsically Disordered Region of p53: A Molecular Dynamics Investigation

Bakker, M. J., Sørensen, H. V. & Skepö, M., 2024, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 20, 3, s. 1423–1433 11 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

H₂ formation from the E₂–E₄ states of nitrogenase

Jiang, H. & Ryde, U., 2024, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 26, 2, s. 1364-1375 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Interactions of intrinsically disordered peptides with phospholipid bilayers

Eriksson Skog, A., 2024, Lund University. 241 s.

Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling (sammanläggning)

Fil

72 Nedladdningar (Pure)

Lipid shape and packing are key for optimal design of pH-sensitive mRNA lipid nanoparticles

Tesei, G., Hsiao, Y. W., Dabkowska, A., Grõnberg, G., Arteta, M. Y., Ulkoski, D., Bray, D. J., Trulsson, M., Ulander, J., Lund, M. & Lindfors, L., 2024, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 121, 2, e2311700120.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2023

A numerical study on orientational arrest and size segregation of dense particle flows using discrete element modeling

Yousefian, Z., 2023 dec. 19, Lund: Lund University (Media-Tryck).

Forskningsoutput: Avhandling › Licentiatavhandling

Öppen tillgång

Fil

7 Nedladdningar (Pure)

Beräkningskemi

Forskningsoutput

Sökresultat