Avd. bedriver grundforskning inom mikrobiologi, immunologi och glykobiologi, samt överbryggande forskning med klinisk inriktning. Molekylär bakteriell patogenes avser de mekanismer bakterier använder för att orsaka sjukdom med särskilt fokus kring infektioner i luftvägar, magtarmkanal, urinvägar och hud. Patogenerna orsakar intrikata cellbiologiska effekter. Den immunologiska forskningen inom avd. omfattar slemhinneimmunitet och de tidiga delarna av infektionsförsvaret mot slemhinnepatogener. I andra projekt studeras hur immunglobuliner och andra komponenter i immunsystemet interagerar med bakterieproteiner. Vidare studeras komplementsystemets genetik och funktion i relation till autoimmunitet och infektionsförsvar. Verksamheten inom området glykobiologi rör isolering och karakterisering av glykokonjugat och kolhydrat-bindande proteiner (lektiner). Vidare studeras hur den ofta förekommande interaktionen mellan protein och kolhydrat påverkar värd-patogen interaktion, inflammation och cancer.