Åke Borg

2025

The DNA methylation landscape of primary triple-negative breast cancer

Aine, M., Nacer, D. F., Arbajian, E., Veerla, S., Karlsson, A., Häkkinen, J., Johansson, H. J., Rosengren, F., Vallon-Christersson, J., Borg, Å. & Staaf, J., 2025 mars 28, I: Nature Communications. 16, s. 1-23 3041.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Genomic Characteristics Related to Histology-based Immune Features in Breast Cancer

Cha, Y. J., O'Connell, C. E., Calhoun, B. C., Felsheim, B. M., Fernandez-Martinez, A., Fan, C., Brueffer, C., Larsson, C., Borg, Å., Saal, L. H. & Perou, C. M., 2025, I: Modern Pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc. 38, 5, 100736.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Genomic characterization of the HER2-enriched intrinsic molecular subtype in primary ER-positive HER2-negative breast cancer

Hohmann, L., Sigurjonsdottir, K., Campos, A. B., Nacer, D. F., Veerla, S., Rosengren, F., Reddy, P. T., Häkkinen, J., Nordborg, N., Vallon-Christersson, J., Memari, Y., Black, D., Bowden, R., Davies, H. R., Borg, Å., Nik-Zainal, S. & Staaf, J., 2025, I: Nature Communications. 16, s. 1-17 2208.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2023

BRCA1 frameshift variants leading to extended incorrect protein C termini

Nepomuceno, T. C., Foo, T. K., Richardson, M. E., Ranola, J. M. O., Weyandt, J., Varga, M. J., Alarcon, A., Gutierrez, D., von Wachenfeldt, A., Eriksson, D., Kim, R., Armel, S., Iversen, E., Couch, F. J., Borg, Å., Xia, B., Carvalho, M. A. & Monteiro, A. N. A., 2023 okt. 12, I: Human Genetics and Genomics Advances. 4, 4, 100240.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Matched analysis of circulating selenium with the breast cancer selenotranscriptome: a multicentre prospective study

Demircan, K., Bengtsson, Y., Samson Chillon, T., Vallon-Christersson, J., Sun, Q., Larsson, C., Malmberg, M., Saal, L., Ryden, L., Borg, Å., Manjer, J. & Schomburg, L., 2023 sep. 23, I: Journal of Translational Medicine. 658.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Extended genetic analysis and tumor characteristics in over 4600 women with suspected hereditary breast and ovarian cancer

Öfverholm, A., Törngren, T., Rosén, A., Arver, B., Einbeigi, Z., Haraldsson, K., Ståhlbom, A. K., Kuchinskaya, E., Lindblom, A., Melin, B., Paulsson-Karlsson, Y., Stenmark-Askmalm, M., Tham, E., von Wachenfeldt, A., Kvist, A., Borg, Å. & Ehrencrona, H., 2023 aug. 10, I: BMC Cancer. 23, s. 1-12 738.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Serum copper, zinc and copper/zinc ratio in relation to survival after breast cancer diagnosis: A prospective multicenter cohort study

Bengtsson, Y., Demircan, K., Vallon-Christersson, J., Malmberg, M., Saal, L., Ryden, L., Borg, Å., Schomburg, L., Sandsveden, M. & Manjer, J., 2023 maj 16, I: Redox Biology. 63, 102728.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Molecular characteristics of breast tumors in patients screened for germline predisposition from a population-based observational study

Nacer, D. F., Vallon-Christersson, J., Nordborg, N., Ehrencrona, H., Kvist, A., Borg, Å. & Staaf, J., 2023 apr. 14, I: Genome Medicine. 15, s. 1-20 25.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Obesity-associated changes in molecular biology of primary breast cancer

Nguyen, H.-L., Borg, A., Desmedt, C. & et al., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 4418.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Ovarian cancer pathology characteristics as predictors of variant pathogenicity in BRCA1 and BRCA2

O’Mahony, D. G., Borg, A., Chung, W. K., HEBON Investigators, GEMO Study Collaborators, AOCS study group, CZECANCA Consortium, Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA and BRCA2 & Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium, 2023, I: British Journal of Cancer. 128, s. 2283–2294 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Validation of the BOADICEA model for predicting the likelihood of carrying pathogenic variants in eight breast and ovarian cancer susceptibility genes

Møller, N. B., Boonen, D. S., Feldner, E. S., Hao, Q., Larsen, M., Lænkholm, A. V., Borg, Å., Kvist, A., Törngren, T., Jensen, U. B., Boonen, S. E., Thomassen, M. & Terkelsen, T., 2023, I: Scientific Reports. 13, 1, 8536.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2022

Clinical, splicing, and functional analysis to classify BRCA2 exon 3 variants: Application of a points-based ACMG/AMP approach

Thomassen, M., Mesman, R. L. S., Hansen, T. V. O., Menendez, M., Rossing, M., Esteban-Sánchez, A., Tudini, E., Törngren, T., Parsons, M. T., Pedersen, I. S., Teo, S. H., Kruse, T. A., Møller, P., Borg, Å., Jensen, U. B., Christensen, L. L., Singer, C. F., Muhr, D., Santamarina, M. & Brandao, R. & 30 andra, Andresen, B. S., Feng, B. J., Canson, D., Richardson, M. E., Karam, R., Pesaran, T., LaDuca, H., Conner, B. R., Abualkheir, N., Hoang, L., Calléja, F. M. G. R., Andrews, L., James, P. A., Bunyan, D., Hamblett, A., Radice, P., Goldgar, D. E., Walker, L. C., Engel, C., Claes, K. B. M., Macháčková, E., Baralle, D., Viel, A., Wappenschmidt, B., Lazaro, C., Vega, A., Vreeswijk, M. P. G., de la Hoya, M., Spurdle, A. B. & ENIGMA Consortium, 2022 dec., I: Human Mutation. 43, 12, s. 1921-1944 24 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Merged testing for colorectal cancer syndromes and re-evaluation of genetic variants improve diagnostic yield: Results from a nationwide prospective cohort

Svensson, S., Zagoras, T., Aravidis, C., Askmalm, M. S., Björck, E., Borg, Å., Kuchinskaya, E., Nilbert, M., Nordling, M., Rohlin, A., Silander, G., Lagerstedt-Robinson, K. & Gebre-Medhin, S., 2022 okt., I: Genes Chromosomes and Cancer. 61, 10, s. 585-591 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

How Reliable Are Gene Expression-Based and Immunohistochemical Biomarkers Assessed on a Core-Needle Biopsy? A Study of Paired Core-Needle Biopsies and Surgical Specimens in Early Breast Cancer

Saghir, H., Veerla, S., Malmberg, M., Rydén, L., Ehinger, A., Saal, L. H., Vallon-Christersson, J., Borg, Å., Hegardt, C., Larsson, C., Haidar, A., Hedenfalk, I., Loman, N. & Kimbung, S., 2022 aug. 18, I: Cancers. 14, 16, s. 1-16 4000.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer

Staaf, J., Häkkinen, J., Hegardt, C., Saal, L. H., Kimbung, S., Hedenfalk, I., Lien, T., Sørlie, T., Naume, B., Russnes, H., Marcone, R., Ayyanan, A., Brisken, C., Malterling, R. R., Asking, B., Olofsson, H., Lindman, H., Bendahl, P.-O., Ehinger, A. & Larsson, C. & 5 andra, Loman, N., Rydén, L., Malmberg, M., Borg, Å. & Vallon-Christersson, J., 2022 aug. 16, I: npj Breast Cancer. 8, s. 1-17 94.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Autoimmunity to selenoprotein P predicts breast cancer recurrence

Demircan, K., Sun, Q., Bengtsson, Y., Seemann, P., Vallon-Christersson, J., Malmberg, M., Saal, L., Ryden, L., Minich, W. B., Borg, Å., Manjer, J. & Schomburg, L., 2022 maj 25, I: Redox Biology. 53, 102346.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Cancer Risks Associated With BRCA1 and BRCA2 Pathogenic Variants

Li, S., Borg, Å., Antoniou, A. C. & et al., 2022 maj 10, I: Journal of Clinical Oncology. 40, 14, s. 1529-1541 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

RNA sequencing-based single sample predictors of molecular subtype and risk of recurrence for clinical assessment of early-stage breast cancer

Vallon-Christersson, J., Staaf, J., Häkkinen, J., Hegardt, C., Saal, L., Ehinger, A., Larsson, C., Loman, N., Rydén, L., Malmberg, M. & Borg, Å., 2022 maj 1, I: Annals of Oncology. 33, Suppl 3, s. S144-S145 52P.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Publicerat konferensabstract › Peer review

Fil

48 Nedladdningar (Pure)

Breast and Prostate Cancer Risks for Male BRCA1 and BRCA2 Pathogenic Variant Carriers Using Polygenic Risk Scores

Barnes, D. R., Borg, A., Ottini, L. & et al., 2022, I: Journal of the National Cancer Institute. 114, 1, s. 109-122 14 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Interval breast cancer is associated with interferon immune response

Ugalde-Morales, E., Grassmann, F., Humphreys, K., Li, J., Eriksson, M., Tobin, N. P., Lindström, L. S., Vallon-Christersson, J., Borg, Å., Hall, P. & Czene, K., 2022, I: European Journal of Cancer. 162, s. 194-205 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Risks of breast and ovarian cancer for women harboring pathogenic missense variants in BRCA1 and BRCA2 compared with those harboring protein truncating variants

Li, H., Borg, Å., Goldgar, D. E., ENIGMA Consortium & CIMBA Consortium, 2022, I: Genetics in Medicine. 24, 1, s. 119-129

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2021

Sample preparation approach influences pam50 risk of recurrence score in early breast cancer

Lien, T. G., Ohnstad, H. O., Lingjærde, O. C., Vallon-Christersson, J., Aaserud, M., Sveli, M. A. T., Borg, Å., Garred, Ø., Borgen, E., Naume, B., Russnes, H., Sørlie, T. & on behalf of OSBREAC, 2021 dec., I: Cancers. 13, 23, 6118.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Precision oncology of high-grade ovarian cancer defined through targeted sequencing

Wessman, S., Fuentes, B. B., Törngren, T., Kvist, A., Kokaraki, G., Menkens, H., Hjerpe, E., Hugo, Y., Petta, T. B., Borg, Å. & Carlson, J. W., 2021 okt. 1, I: Cancers. 13, 20, 5240.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

A search for modifying genetic factors in CHEK2:c.1100delC breast cancer patients

Wendt, C., Muranen, T. A., Mielikäinen, L., Thutkawkorapin, J., Blomqvist, C., Jiao, X., Ehrencrona, H., Tham, E., Arver, B., Melin, B., Kuchinskaya, E., Stenmark Askmalm, M., Paulsson-Karlsson, Y., Einbeigi, Z., von Wachenfeldt Väppling, A., Kalso, E., Tasmuth, T., Kallioniemi, A., Aittomäki, K. & Nevanlinna, H. & 2 andra, Borg, Å. & Lindblom, A., 2021 juli 20, I: Scientific Reports. 11, s. 1-9 14763.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Preexisting Somatic Mutations of Estrogen Receptor Alpha (ESR1) in Early-Stage Primary Breast Cancer

Dahlgren, M., George, A., Brueffer, C., Gladchuk, S., Chen, Y., Vallon-Christersson, J., Hegardt, C., Häkkinen, J., Ryden, L., Malmberg, M., Larsson, C., Gruvberger, S., Ehinger, A., Loman, N., Borg, Å. & Saal, L., 2021 apr. 22, I: JNCI Cancer Spectrum. 5, 2, pkab028.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Distinct mechanisms of resistance to fulvestrant treatment dictate level of ER independence and selective response to CDK inhibitors in metastatic breast cancer

Kaminska, K., Akrap, N., Staaf, J., Alves, C. L., Ehinger, A., Ebbesson, A., Hedenfalk, I., Beumers, L., Veerla, S., Harbst, K., Ehmsen, S., Borgquist, S., Borg, Å., Pérez-Fidalgo, A., Ditzel, H. J., Bosch, A. & Honeth, G., 2021 feb. 18, I: Breast cancer research : BCR. 23, 1, s. 26

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Association between breast cancer risk and disease aggressiveness: Characterizing underlying gene expression patterns

Ugalde-Morales, E., Grassmann, F., Humphreys, K., Li, J., Eriksson, M., Tobin, N. P., Borg, Å., Vallon-Christersson, J., Hall, P. & Czene, K., 2021 feb. 15, I: International Journal of Cancer. 148, 4, s. 884-894 11 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Molecular analyses of triple-negative breast cancer in the young and elderly

Aine, M., Boyaci, C., Hartman, J., Häkkinen, J., Mitra, S., Campos, A. B., Nimeus, E., Ehinger, A., Vallon-Christersson, J., Borg, Å. & Staaf, J., 2021 feb. 10, I: Breast cancer research : BCR. 23, 1, 20.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

et al., Coignard, J., Augustinsson, A., Olsson, H., Borg, Å. & Antoniou, A. C., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 1078.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Breast cancer risk genes - Association analysis in more than 113,000 women

Dorling, L., Valcich, J., Li, M., Törngren, T., Borg, Å., Kvist, A. & Easton, D. F., 2021, I: New England Journal of Medicine. 384, 5, s. 428-439 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

CDKN2A genetic testing in melanoma-prone families in Sweden in the years 2015-2020: implications for novel national recommendations

Pissa, M., Helkkula, T., Appelqvist, F., Silander, G., Borg, Å., Pettersson, J., Lapins, J., Nielsen, K., Höiom, V. & Helgadottir, H., 2021, I: Acta oncologica (Stockholm, Sweden). 60, 7, s. 888-896 9 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Serum selenium, selenoprotein P and glutathione peroxidase 3 as predictors of mortality and recurrence following breast cancer diagnosis: A multicentre cohort study

Demircan, K., Bengtsson, Y., Sun, Q., Brange, A., Vallon-Christersson, J., Rijntjes, E., Malmberg, M., Saal, L., Ryden, L., Borg, Å., Manjer, J. & Schomburg, L., 2021, I: Redox Biology. 47, s. 1-12 102145.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Spatial deconvolution of HER2-positive breast cancer delineates tumor-associated cell type interactions

Andersson, A., Larsson, L., Stenbeck, L., Salmén, F., Ehinger, A., Wu, S. Z., Al-Eryani, G., Roden, D., Swarbrick, A., Borg, Å., Frisén, J., Engblom, C. & Lundeberg, J., 2021, I: Nature Communications. 12, 6012.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

The predictive ability of the 313 variant–based polygenic risk score for contralateral breast cancer risk prediction in women of European ancestry with a heterozygous BRCA1 or BRCA2 pathogenic variant

Lakeman, I. M. M., Borg, Å., Schmidt, M. K., GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, OCGN Investigators, HEBON Investigators & KConFab Investigators, 2021, I: Genetics in Medicine. 23, 9, s. 1726-1737 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

The spatial RNA integrity number assay for in situ evaluation of transcriptome quality

Kvastad, L., Carlberg, K., Larsson, L., Villacampa, E. G., Stuckey, A., Stenbeck, L., Mollbrink, A., Zamboni, M., Magnusson, J. P., Basmaci, E., Shamikh, A., Prochazka, G., Schaupp, A. L., Borg, Å., Fugger, L., Nistér, M. & Lundeberg, J., 2021, I: Communications Biology. 4, 1, 57.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2020

Breast cancer survival in Nordic BRCA2 mutation carriers—unconventional association with oestrogen receptor status

Olafsdottir, E. J., Borg, A., Jensen, M. B., Gerdes, A. M., Johansson, A. L. V., Barkardottir, R. B., Johannsson, O. T., Ejlertsen, B., Sønderstrup, I. M. H., Hovig, E., Lænkholm, A. V., Hansen, T. V. O., Olafsdottir, G. H., Rossing, M., Jonasson, J. G., Sigurdsson, S., Loman, N., Nilsson, M. P., Narod, S. A. & Tryggvadottir, L., 2020 nov. 24, I: British Journal of Cancer. 123, 11, s. 1608-1615 8 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Bailey, M. H., Meyerson, W. U., Dursi, L. J., Wang, L. B., Dong, G., Liang, W. W., Weerasinghe, A., Li, S., Kelso, S., Saksena, G., Ellrott, K., Wendl, M. C., Wheeler, D. A., Getz, G., Simpson, J. T., Gerstein, M. B., Ding, L., Borg, A. (medarbetare), Ehinger, A. (medarbetare) & Glodzik, D. (medarbetare) & 8 andra, Grabau, D. (medarbetare), Huang, M. N. (medarbetare), Li, C. (medarbetare), Ringnér, M. (medarbetare), Staaf, J. (medarbetare), MC3 Working Group, PCAWG novel somatic mutation calling methods working group & PCAWG Consortium, 2020 sep. 21, I: Nature Communications. 11, 1, 4748.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

The mutational landscape of the SCAN‐B real‐world primary breast cancer transcriptome

Brueffer, C., Gladchuk, S., Winter, C., Vallon-Christersson, J., Hegardt, C., Häkkinen, J., George, A., Chen, Y., Ehinger, A., Larsson, C., Loman, N., Malmberg, M., Ryden, L., Borg, Å. & Saal, L., 2020 sep. 14, I: EMBO Molecular Medicine. 12, 10, e12118.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Sex differences in oncogenic mutational processes

Li, C. H., Prokopec, S. D., Sun, R. X., Yousif, F., Schmitz, N., Al-Shahrour, F., Atwal, G., Bailey, P. J., Biankin, A. V., Boutros, P. C., Campbell, P. J., Chang, D. K., Cooke, S. L., Deshpande, V., Faltas, B. M., Faquin, W. C., Garraway, L., Getz, G., Grimmond, S. M. & Haider, S. & 31 andra, Hoadley, K. A., Jiao, W., Kaiser, V. B., Karlić, R., Kato, M., Kübler, K., Lazar, A. J., Wright, D. W., Borg, A., Davis, I. J., Ehinger, A., Glodzik, D., Grabau, D., Huang, M. N., Johansson, P. A., Larsson, E., Li, C., Li, H. I., Li, J., Möller, P., Ringnér, M., Song, L., Staaf, J., Wang, J., Wang, Q., Yang, Y., Zhang, F., Zhang, J., Zhang, Y., PCAWG Tumour Subtypes and Clinical Translation & PCAWG Consortium, 2020 aug. 28, I: Nature Communications. 11, 24 s., 4330.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Abstract CT074: Pre-existing ESR1 mutations in early-stage primary breast cancer predict failure of endocrine therapy and poor survival

Dahlgren, M., George, A., Brueffer, C., Gladchuk, S., Chen, Y., Vallon-Christersson, J., Hegardt, C., Häkkinen, J., Ryden, L., Malmberg, M., Larsson, C., Gruvberger, S., Ehinger, A., Loman, N., Borg, Å. & Saal, L., 2020 aug., I: Cancer research. Supplement. 80, 16

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Publicerat konferensabstract

Integrating spatial gene expression and breast tumour morphology via deep learning

He, B., Bergenstråhle, L., Stenbeck, L., Abid, A., Andersson, A., Borg, Å., Maaskola, J., Lundeberg, J. & Zou, J., 2020 aug., I: Nature Biomedical Engineering. 4, 8, s. 827-834 8 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Prognostic implications of the expression levels of different immunoglobulin heavy chain-encoding RNAs in early breast cancer

Larsson, C., Ehinger, A., Winslow, S., Leandersson, K., Klintman, M., Dahl, L., Vallon-christersson, J., Häkkinen, J., Hegardt, C., Manjer, J., Saal, L., Rydén, L., Malmberg, M., Borg, Å. & Loman, N., 2020 juli 6, I: npj Breast Cancer. 6, 1, 28.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Transcriptome-wide association study of breast cancer risk by estrogen-receptor status.

Feng, H., Borg, Å., Olsson, H., GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, GC-HBOC Study Collaborators & Ellberg, C., 2020 juli, I: Genetic Epidemiology. 44, 5, s. 442-468 27 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer

Persson, H., Søkilde, R., Häkkinen, J., Vallon-Christersson, J., Mitelman, F., Borg, Å., Höglund, M. & Rovira, C., 2020 juni 15, I: International Journal of Cancer. 146, 12, s. 3343-3353 11 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Defining the mutational landscape of 3,217 primary breast cancer transcriptomes through large-scale RNA-seq within the Sweden Cancerome Analysis Network: Breast Project (SCAN-B; NCT03430492).

Brueffer, C., Gladchuk, S., Winter, C., Vallon-christersson, J., Hegardt, C., Häkkinen, J., George, A. M., Chen, Y., Ehinger, A., Larsson, C., Loman, N., Malmberg, M., Rydén, L., Borg, Å. & Saal, L. H., 2020 maj 20, I: Journal of Clinical Oncology. 38, 15_suppl, s. 518-518

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Publicerat konferensabstract

Cancer risks associated with germline PALB2 pathogenic variants: An international study of 524 families

Yang, X., Leslie, G., Doroszuk, A., Schneider, S., Allen, J., Decker, B., Dunning, A. M., Redman, J., Scarth, J., Plaskocinska, I., Luccarini, C., Shah, M., Pooley, K., Dorling, L., Leei, A., Adank, M. A., Adlard, J., Aittomäki, K., Andrulis, I. L. & Ang, P. & 99 andra, Barwell, J., Bernstein, J. L., Bobolis, K., Borg, Å., Blomqvist, C., Claes, K. B. M., Concannon, P., Cuggia, A., Culver, J. O., Damiola, F., De Pauw, A., Diez, O., Dolinsky, J. S., Domchek, S. M., Engel, C., Evans, D. G., Fostira, F., Garber, J., Golmard, L., Goode, E. L., Gruber, S. B., Hahnen, E., Hake, C., Heikkinen, T., Hurley, J. E., Janavicius, R., Kleibl, Z., Kleiblova, P., Konstantopoulou, I., Kvist, A., Laduca, H., Lee, A. S. G., Lesueur, F., Maher, E. R., Mannermaa, A., Manoukian, S., McFarland, R., McKinnon, W., Meindl, A., Metcalfe, K., Taib, N. A. M., Moilanen, J., Nathanson, K. L., Neuhausen, S., Ng, P. S., Nguyen-Dumont, T., Nielsen, S. M., Obermair, F., Offit, K., Olopade, O. I., Ottini, L., Penkert, J., Pylkäs, K., Goldgar, D., Ramus, S. J., Rudaitis, V., Side, L., Silva-Smith, R., Silvestri, V., Skytte, A. B., Slavin, T., Soukupova, J., Tondini, C., Trainer, A. H., Unzeitig, G., Usha, L., Van Overeem Hansen, T., Whitworth, J., Wood, M., Yip, C. H., Yoon, S. Y., Yussuf, A., Zogopoulos, G., Radice, P., Hopper, J. L., Chenevix-Trench, G., Pharoah, P., George, S. H. L., Balmaña, J., Houdayer, C., James, P., El-Haffaf, Z., Ehrencrona, H., Janatova, M., Peterlongo, P., Nevanlinna, H., Schmutzler, R., Teo, S. H., Robson, M., Pal, T., Couch, F., Weitzel, J. N., Elliott, A., Southey, M., Winqvist, R., Easton, D. F., Foulkes, W. D., Antoniou, A. C. & Tischkowitz, M., 2020 mars 1, I: Journal of Clinical Oncology. 38, 7, s. 674-685

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes

Yakneen, S., Waszak, S. M., Gertz, M., Korbel, J. O., Borg, Å. (medarbetare), Ringnér, M. (medarbetare), Staaf, J. (medarbetare), PCAWG Technical Working Group & PCAWG Consortium, 2020 mars, I: Nature Biotechnology. 38, 3, s. 288-292

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

Cortés-Ciriano, I., Lee, J.J.-K., Xi, R., Jain, D., Jung, Y. L., Yang, L., Gordenin, D., Klimczak, L. J., Zhang, C.-Z., Pellman, D. S., Park, P. J., Borg, Å. (medarbetare), Ringnér, M. (medarbetare), Staaf, J. (medarbetare), PCAWG-Structural Variation Working Group & PCAWG Consortium, 2020 mars, I: Nature Genetics. 52, 3, s. 331-341

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancers

Yuan, Y., Ju, Y. S., Kim, Y., Li, J., Wang, Y., Yoon, C. J., Yang, Y., Martincorena, I., Creighton, C. J., Weinstein, J. N., Xu, Y., Han, L., Kim, H.-L., Nakagawa, H., Park, K., Campbell, P. J., Liang, H., Borg, Å. (medarbetare), Ringnér, M. (medarbetare) & Staaf, J. (medarbetare) & 1 andra, PCAWG Consortium, 2020 mars, I: Nature Genetics. 52, 3, s. 342-352

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

Akdemir, K. C., Le, V. T., Chandran, S., Li, Y., Verhaak, R. G., Beroukhim, R., Campbell, P. J., Chin, L., Dixon, J. R., Futreal, P. A., Borg, Å. (medarbetare), Ringnér, M. (medarbetare), Staaf, J. (medarbetare), PCAWG-Structural Variation Working Group & PCAWG Consortium, 2020 mars, I: Nature Genetics. 52, 3, s. 294-305

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Åke Borg

Forskningsoutput

Sökresultat