Deniz Kirik

2024

Novel tools to quantify total, phospho-Ser129 and aggregated alpha-synuclein in the mouse brain

Trist, B. G., Wright, C. J., Rangel, A., Cottle, L., Prasad, A., Jensen, N. M., Gram, H., Dzamko, N., Jensen, P. H. & Kirik, D., 2024 dec., I: npj Parkinson's Disease. 10, 1, 217.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Image post-processing for SILMAS: structured illumination light sheet microscopy with axial sweeping

Frantz, D., Wright, C. J., Schaser, A. J., Kirik, D., Kristensson, E. & Berrocal, E., 2024 aug., I: Biomedical Optics Express. 15, 8, s. 4943-4962 20 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Basal activity of PINK1 and PRKN in cell models and rodent brain

Watzlawik, J. O., Fiesel, F. C., Fiorino, G., Bustillos, B. A., Baninameh, Z., Markham, B. N., Hou, X., Hayes, C. S., Bredenberg, J. M., Kurchaba, N. W., Fričová, D., Siuda, J., Wszolek, Z. K., Noda, S., Sato, S., Hattori, N., Prasad, A. A., Kirik, D., Fox, H. S. & Stauch, K. L. & 2 andra, Goldberg, M. S. & Springer, W., 2024, I: Autophagy. 20, 5, s. 1147-1158 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2023

Inactive S. aureus Cas9 downregulates alpha-synuclein and reduces mtDNA damage and oxidative stress levels in human stem cell model of Parkinson’s disease

Sastre, D., Zafar, F., Torres, C. A. M., Piper, D., Kirik, D., Sanders, L. H., Qi, L. S. & Schüle, B., 2023 dec., I: Scientific Reports. 13, 1, 17796.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Effects of mutant huntingtin in oxytocin neurons on non-motor features of Huntington's disease

Bergh, S., Gabery, S., Tonetto, S., Kirik, D., Petersén, Å. & Cheong, R. Y., 2023 apr., I: Neuropathology and Applied Neurobiology. 49, 2, e12891.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Generation of human-induced pluripotent-stem-cell-derived cortical neurons for high-throughput imaging of neurite morphology and neuron maturation

Wali, G., Li, Y., Abu-Bonsrah, D., Kirik, D., Parish, C. L. & Sue, C. M., 2023, I: STAR Protocols. 4, 2, 102325.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Generation of the iPSC line FINi002-A from a male Parkinson's disease patient carrying compound heterozygous mutations in the PRKN gene

Pavan, C., Jin, J., Jong, S., Strbenac, D., Davis, R. L., Sue, C. M., Johnston, J., Lynch, T., Halliday, G., Kirik, D., Parish, C. L., Thompson, L. H. & Ovchinnikov, D. A., 2023, I: Stem Cell Research. 73, 103211.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2022

Combining CRISPR-Cas9 and brain imaging to study the link from genes to molecules to networks

Marciano, S., Ionescu, T. M., Saw, R. S., Cheong, R. Y., Kirik, D., Maurer, A., Pichler, B. J. & Herfert, K., 2022 okt. 4, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 40, e2122552119.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

High contrast, isotropic, and uniform 3D-imaging of centimeter-scale scattering samples using structured illumination light-sheet microscopy with axial sweeping

Frantz, D., Karamahmutoglu, T., Schaser, A. J., Kirik, D. & Berrocal, E., 2022 sep. 1, I: Biomedical Optics Express. 13, 9, s. 4907-4925 19 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

A combined cell and gene therapy approach for homotopic reconstruction of midbrain dopamine pathways using human pluripotent stem cells

Moriarty, N., Gantner, C. W., Hunt, C. P. J., Ermine, C. M., Frausin, S., Viventi, S., Ovchinnikov, D. A., Kirik, D., Parish, C. L. & Thompson, L. H., 2022 mars 3, I: Cell Stem Cell. 29, 3, s. 434-448.e5

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Prolongation of absence seizures and changes in serotonergic and dopaminergic neurotransmission by nigrostriatal pathway degeneration in genetic absence epilepsy rats

Tugba, E. K., Medine, G. I. O., Ozlem, A., Deniz, K. & Filiz, O. Y., 2022, I: Pharmacology Biochemistry and Behavior. 213, 173317.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2021

DNAJB6 suppresses alpha-synuclein induced pathology in an animal model of Parkinson's disease

Arkan, S., Ljungberg, M., Kirik, D. & Hansen, C., 2021 okt., I: Neurobiology of Disease. 158, 105477.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Effects of mutant huntingtin inactivation on Huntington disease-related behaviours in the BACHD mouse model

Cheong, R. Y., Baldo, B., Sajjad, M. U., Kirik, D. & Petersén, Å., 2021 juni 1, I: Neuropathology and Applied Neurobiology. 47, 4, s. 564-578 15 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Comparison of Locus Coeruleus Pathology with Nigral and Forebrain Pathology in Parkinson's Disease

Huynh, B., Fu, Y., Kirik, D., Shine, J. M. & Halliday, G. M., 2021, I: Movement Disorders. 36, 9, s. 2085-2093

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Positive symptom phenotypes appear progressively in “EDiPS”, a new animal model of the schizophrenia prodrome

Petty, A., Cui, X., Ali, A., Du, Z., Srivastav, S., Kesby, J. P., Kirik, D., Howes, O. & Eyles, D., 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 4294.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Viral-based rodent and nonhuman primate models of multiple system atrophy: Fidelity to the human disease

Marmion, D. J., Rutkowski, A. A., Chatterjee, D., Hiller, B. M., Werner, M. H., Bezard, E., Kirik, D., McCown, T., Gray, S. J. & Kordower, J. H., 2021, I: Neurobiology of Disease. 148, 105184.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2020

Two C-terminal sequence variations determine differential neurotoxicity between human and mouse α-synuclein

Landeck, N., Strathearn, K. E., Ysselstein, D., Buck, K., Dutta, S., Banerjee, S., Lv, Z., Hulleman, J. D., Hindupur, J., Lin, L. K., Padalkar, S., Stanciu, L. A., Lyubchenko, Y. L., Kirik, D. & Rochet, J. C., 2020, I: Molecular Neurodegeneration. 15, 1, 49.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Viral Delivery of GDNF Promotes Functional Integration of Human Stem Cell Grafts in Parkinson's Disease

Gantner, C. W., de Luzy, I. R., Kauhausen, J. A., Moriarty, N., Niclis, J. C., Bye, C. R., Penna, V., Hunt, C. P. J., Ermine, C. M., Pouton, C. W., Kirik, D., Thompson, L. H. & Parish, C. L., 2020, I: Cell Stem Cell. 26, 4, s. 511-526.e5

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2019

Enhanced Dopamine in Prodromal Schizophrenia (EDiPS): a new animal model of relevance to schizophrenia

Petty, A., Cui, X., Tesiram, Y., Kirik, D., Howes, O. & Eyles, D., 2019, I: npj Schizophrenia. 5, 1, 6.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Organotypic slice culture model demonstrates inter-neuronal spreading of alpha-synuclein aggregates

Elfarrash, S., Jensen, N. M., Ferreira, N., Betzer, C., Thevathasan, J. V., Diekmann, R., Adel, M., Omar, N. M., Boraie, M. Z., Gad, S., Ries, J., Kirik, D., Nabavi, S. & Jensen, P. H., 2019, I: Acta Neuropathologica Communications. 7, 1, 213.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

SIRT1 is increased in affected brain regions and hypothalamic metabolic pathways are altered in Huntington disease

Baldo, B., Gabery, S., Soylu-Kucharz, R., Cheong, R. Y., Henningsen, J. B., Englund, E., McLean, C., Kirik, D., Halliday, G. & Petersén, 2019, I: Neuropathology and Applied Neurobiology. 45, 4, s. 361-379

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2018

Preserved function of afferent parvalbumin-positive perisomatic inhibitory synapses of dentate granule cells in rapidly kindled mice

Hansen, M. G., Ledri, L. N., Kirik, D., Kokaia, M. & Ledri, M., 2018 jan. 9, I: Frontiers in Cellular Neuroscience. 11, 433.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

In vivo quantification of glial activation in minipigs overexpressing human α-synuclein

Lillethorup, T. P., Glud, A. N., Landeck, N., Alstrup, A. K. O., Jakobsen, S., Vang, K., Doudet, D. J., Brooks, D. J., Kirik, D., Hinz, R., Sørensen, J. C. & Landau, A. M., 2018, I: Synapse. 72, 12, e22060.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Longitudinal monoaminergic PET imaging of chronic proteasome inhibition in minipigs

Lillethorup, T. P., Glud, A. N., Alstrup, A. K. O., Noer, O., Nielsen, E. H. T., Schacht, A. C., Landeck, N., Kirik, D., Orlowski, D., Sørensen, J. C. H., Doudet, D. J. & Landau, A. M., 2018, I: Scientific Reports. 8, 1, 15715.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Quantification of Total and Mutant Huntingtin Protein Levels in Biospecimens Using a Novel alphaLISA Assay

Baldo, B., Sajjad, M. U., Cheong, R. Y., Bigarreau, J., Vijayvargia, R., McLean, C., Perrier, A. L., Seong, I. S., Halliday, G., Petersén, Å. & Kirik, D., 2018, I: eNeuro. 5, 4

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

2017

Novel oligodendroglial alpha synuclein viral vector models of multiple system atrophy: studies in rodents and nonhuman primates

Mandel, R. J., Marmion, D. J., Kirik, D., Chu, Y., Heindel, C., McCown, T., Gray, S. J. & Kordower, J. H., 2017 juni 16, I: Acta Neuropathologica Communications. 5, 1, s. 47

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Toxic effects of human and rodent variants of alpha-synuclein in vivo

Landeck, N., Buck, K. & Kirik, D., 2017 feb. 1, I: European Journal of Neuroscience. 45, 4, s. 536-547 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Interaction between subclinical doses of the Parkinson's disease associated gene, α-synuclein, and the pesticide, rotenone, precipitates motor dysfunction and nigrostriatal neurodegeneration in rats

Naughton, C., O'Toole, D., Kirik, D. & Dowd, E., 2017 jan. 1, I: Behavioural Brain Research. 316, s. 160-168 9 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2016

A novel multiplex assay for simultaneous quantification of total and S129 phosphorylated human alpha-synuclein

Landeck, N., Hall, H., Ardah, M. T., Majbour, N. K., El-Agnaf, O. M. A., Halliday, G. & Kirik, D., 2016 aug. 22, I: Molecular Neurodegeneration. 11, 1, 125.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Assessment of brain metabolite correlates of AAV-mediated overexpression of human alpha-synuclein in cortical neurons by in vivo(1) H-MR spectroscopy at 9.4 T.

Cuellar-Baena, S., Landeck, N., Sonnay, S., Buck, K., Mlynarik, V., in 't Zandt, R. & Kirik, D., 2016, I: Journal of Neurochemistry. 137, 5, s. 806-819

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

2015

A doctor's dilemma

Kirik, D. & Pain, E., 2015 nov. 20, I: Science (New York, N.Y.). 350, 6263, s. 998

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift

Controlled striatal DOPA production from a gene delivery system in a rodent model of Parkinson's disease.

Cederfjäll, E., Broom, L. & Kirik, D., 2015, I: Molecular Therapy. 23, 5, s. 896-906

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Fil

178 Nedladdningar (Pure)

Hypothalamic overexpression of mutant huntingtin causes dysregulation of brown adipose tissue.

Soylu, R., Adlesic, N., Baldo, B., Kirik, D. & Petersén, Å., 2015, I: Scientific Reports. 5, 14598.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Fil

292 Nedladdningar (Pure)

Overexpression of α-synuclein in oligodendrocytes does not increase susceptibility to focal striatal excitotoxicity.

Kuzdas-Wood, D., Fellner, L., Premstaller, M., Borm, C., Bloem, B., Kirik, D., Wenning, G. K. & Stefanova, N., 2015, I: BMC Neuroscience. 16, 1, 86.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Ser129 phosphorylation of endogenous α-synuclein induced by overexpression of polo-like kinases 2 and 3 in nigral dopamine neurons is not detrimental to their survival and function.

Buck, K., Landeck, N., Ulusoy, A., Majbour, N. K., El-Agnaf, O. M. A. & Kirik, D., 2015, I: Neurobiology of Disease. 78, Mar 25, s. 100-114

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Volumetric analysis of the hypothalamus in Huntington Disease using 3T MRI: the IMAGE-HD Study.

Gabery, S., Georgiou-Karistianis, N., Hult Lundh, S., Cheong, R., Churchyard, A., Chua, P., Stout, J. C., Egan, G. F., Kirik, D. & Petersén, Å., 2015, I: PLoS ONE. 10, 2, e0117593.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Fil

475 Nedladdningar (Pure)

2014

Differential Dopamine Receptor Occupancy Underlies L-DOPA-Induced Dyskinesia in a Rat Model of Parkinson's Disease.

Sahin, G., Thompson, L., Lavisse, S., Özgür, M., Rbah-Vidal, L., Dollé, F., Hantraye, P. & Kirik, D., 2014, I: PLoS ONE. 9, 3, e90759.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Fil

235 Nedladdningar (Pure)

Global Optogenetic Activation of Inhibitory Interneurons during Epileptiform Activity.

Ledri, M., Grönning Madsen, M., Nikitidou, L., Kirik, D. & Kokaia, M., 2014, I: The Journal of Neuroscience. 34, 9, s. 3364-3377

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Fil

314 Nedladdningar (Pure)

Heat Shock Protein 70 Reduces alpha-Synuclein-Induced Predegenerative Neuronal Dystrophy in the alpha-Synuclein Viral Gene Transfer Rat Model of Parkinson's Disease

Moloney, T. C., Hyland, R., O'Toole, D., Paucard, A., Kirik, D., O'Doherty, A., Gorman, A. M. & Dowd, E., 2014, I: CNS Neuroscience & Therapeutics. 20, 1, s. 50-58

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Hippocampal Lewy pathology and cholinergic dysfunction are associated with dementia in Parkinson's disease.

Hall, H., Reyes, S., Landeck, N., Bye, C., Leanza, G., Double, K., Thompson, L., Halliday, G. & Kirik, D., 2014, I: Brain. 137, Jul 24, s. 2493-2508

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Optogenetic inhibition of chemically induced hypersynchronized bursting in mice.

Berglind, F., Ledri, M., Sørensen, A. T., Nikitidou, L., Melis, M., Bielefeld, P., Kirik, D., Deisseroth, K., Andersson, M. & Kokaia, M., 2014, I: Neurobiology of Disease. 65, s. 133-141

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Fil

665 Nedladdningar (Pure)

2013

Boosting chaperone-mediated autophagy in vivo mitigates alpha-synuclein-induced neurodegeneration

Xilouri, M., Brekk, O. R., Landeck, N., Pitychoutis, P. M., Papasilekas, T., Papadopoulou-Daifoti, Z., Kirik, D. & Stefanis, L., 2013, I: Brain. 136, s. 2130-2146

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Characterization of cognitive deficits in rats overexpressing human alpha-synuclein in the ventral tegmental area and medial septum using recombinant adeno-associated viral vectors.

Hall, H., Jewett, M., Landeck, N., Nilsson, N., Schagerlöf, U., Leanza, G. & Kirik, D., 2013, I: PLoS ONE. 8, 5, e64844.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Fil

204 Nedladdningar (Pure)

Continuous DOPA synthesis from a single AAV: dosing and efficacy in models of Parkinson's disease.

Cederfjäll, E., Nilsson, N., Sahin, G., Chu, Y., Nikitidou, E., Björklund, T., Kordower, J. H. & Kirik, D., 2013, I: Scientific Reports. 3, 2157.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Öppen tillgång

Fil

214 Nedladdningar (Pure)

Hypothalamic expression of mutant huntingtin contributes to the development of depressive-like behavior in the BAC transgenic mouse model of Huntingtons disease

Hult Lundh, S., Nilsson, N., Soylu, R., Kirik, D. & Petersén, Å., 2013, I: Human Molecular Genetics. 22, 17, s. 3485-3497

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Fil

271 Nedladdningar (Pure)

Ser129D mutant alpha-synuclein induces earlier motor dysfunction while S129A results in distinctive pathology in a rat model of Parkinson's disease

Febbraro, F., Sahin, G., Farran, A., Soares, S., Jensen, P. H., Kirik, D. & Romero-Ramos, M., 2013, I: Neurobiology of Disease. 56, s. 47-58

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

The behavioural and neuropathological impact of intranigral AAV-alpha-synuclein is exacerbated by systemic infusion of the Parkinson's disease-associated pesticide, rotenone, in rats

Mulcahy, P., O'Doherty, A., Paucard, A., O'Brien, T., Kirik, D. & Dowd, E., 2013, I: Behavioural Brain Research. 243, s. 6-15

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Transduced Wild-Type but Not P301S Mutated Human Tau Shows Hyperphosphorylation in Transgenic Mice Overexpressing A30P Mutated Human Alpha-Synuclein

Oksman, M., Wisman, L., Jiang, H., Miettinen, P., Kirik, D. & Tanila, H., 2013, I: Neurodegenerative Diseases. 12, 2, s. 91-102

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Trophic factors differentiate dopamine neurons vulnerable to Parkinson's disease

Reyes, S., Fu, Y., Double, K. L., Cottam, V., Thompson, L. H., Kirik, D., Paxinos, G., Watson, C., Cooper, H. M. & Halliday, G. M., 2013, I: Neurobiology of Aging. 34, 3, s. 873-886

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Variability in Neuronal Expression of Dopamine Receptors and Transporters in the Substantia Nigra

Reyes, S., Cottam, V., Kirik, D., Double, K. L. & Halliday, G. M., 2013, I: Movement Disorders. 28, 10, s. 1351-1359

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review

Deniz Kirik

Forskningsoutput

Sökresultat