Hanna Isaksson startade arbeta på Lunds Universitet 2011 och har sedan 2014 varit del av den nya Institutionen för Biomedicinsk Teknik. Hennes forskningsinriktning är biomekanik, med fokus på benmekanik och mekanobiologi. Forskningen fokuserar på funktionell bildanalys och formmodellering av ben, att förstå skademekanismer i ben, samt att förbättra förståelsen av kvaliteten hos nybildat ben under frakturläkning. Dessutom forskar hon på brosk- och sen-mekanik och mekanobiologi.