Forskningsoutput per år
Forskningsoutput per år
Personlig profil
Forskning
Sonja Aits forskning kombinerar molekylärbiologi med AI och maskininlärning. Särskilt arbetar hon med:
- att förstå hur celldöd och lysosomer fungerar och deras betydelse vid sjukdomar, särskilt cancer,
- att utveckla AI-baserade metoder för analys av medicinska bilder, mikroskopidata och stora biologiska datamängder,
- textanalys (natural language processing) av medicinsk litteratur och patientjournaler för att stödja medicinsk forskning.
Ämnesklassifikation (UKÄ)
- Medicinsk bioteknologi
- Bioinformatik och beräkningsbiologi
- Bioinformatik (Beräkningsbiologi)
- Cell- och molekylärbiologi
- Biologi
- Arbetsmedicin och miljömedicin
- Neurovetenskaper
- Andra medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper
- Signalbehandling
- Datorgrafik och datorseende
- Språkbehandling och datorlingvistik
- Systemvetenskap, informationssystem och informatik
- Miljövetenskap
Fria nyckelord
- Celldöd
- Lysosom
- Apoptos
- High-content mikroskopi
- funktionell genomik
- Bildanalys
- Mikroskopi
- Mitochondrier
- Screening
- bioinformatik
- neurovetenskap
- cancerbiologi
- autofagi
- phenotypisk screening
- neurodegeneration
Expertis relaterad till FN:s globala mål
2015 godkände FN:s medlemsstater 17 Globala mål för en hållbar utveckling, för att utrota fattigdomen, skydda planeten och garantera välstånd för alla. Den här personens arbete relaterar till följande Globala mål:
-
SDG 3 – God hälsa och välbefinnande -
SDG 4 – God utbildning -
SDG 9 – Hållbar industri, innovationer och infrastruktur -
SDG 11 – Hållbara städer och samhällen -
SDG 13 – Bekämpa klimatförändringarna -
SDG 14 – Hav och marina resurser -
SDG 15 – Ekosystem och biologiskt mångfald -
SDG 17 – Genomförande och globalt partnerskap
Fingeravtryck
Utforska forskningsämnen där Sonja Aits är aktiv. Dessa ämnesetiketter kommer från personens arbeten. Tillsammans bildar de ett unikt fingeravtryck.
- 1 Liknande profiler
Samarbeten under de senaste fem åren
Externa samarbeten med länder/områden de senaste 5 åren
Forskningsoutput
-
Mapping disease-environment connections reported in scientific literature at scale with EasyNER
Aasa, C., Boyd, E. & Aits, S., 2025 dec. 2.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Konferenspaper, ej i proceeding/ej förlagsutgivet › Peer review
Öppen tillgång -
Artificial intelligence approaches for mapping the nexus of biodiversity, climate change and human society
Ahmed, R., Aasa, C., Berntsson, P., Skafte, A., Kazemi Rashed, S., Klang, M., Barvesten, A., Olde, O., Lindholm, W., Lamarca Arrizabalaga, A., Nugues, P. & Aits, S., 2025 okt. 22.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Konferensabstract › Peer review
-
An annotated high-content fluorescence microscopy dataset with EGFP-Galectin-3-stained cells and manually labelled outlines
Rashed, S. K., Arvidsson, M., Ahmed, R. & Aits, S., 2025 feb., I: Data in Brief. 58, s. 1-9 111148.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel i vetenskaplig tidskrift › Peer review
Öppen tillgång -
A Deep Learning Pipeline for Genome-Wide Imaging Screen Uncovering Cell Death Regulators
Kazemi Rashed, S., Esbo, K., Miari, M., Arvidsson, M. & Aits, S., 2025 jan. 10, 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, s. 7123Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/Conference proceeding › Konferenspaper i proceeding › Peer review
-
AI regulation — Struggling to Keep Up
Aits, S., 2024 dec. 11, Medium.Forskningsoutput: Övriga bidrag › Webbpublicering/bloggpost › Forskning
-
Environmental toxins as cause of lysosomal damage-induced cell death in animals and humans
Aits, S. (PI), Kazemi Rashed, S. (Forskarstuderande) & Ahmed, R. (Forskarstuderande)
FORMAS, Forskningsrådet för miljö, areella näringar och samhällsbyggande
2020/01/01 → …
Projekt: Forskning
-
Artificial intelligence-based text mining for COVID-19 and other areas of medicine
Aits, S. (PI), Frid, J. (Forskare), Nugues, P. (CoI), Kazemi Rashed, S. (Forskarstuderande), Klang, M. (Forskare) & Berg, J. (Forskare)
Knut and Alice Wallenberg Foundation
2020/01/20 → …
Projekt: Forskning
-
Analysing large-scale microscopy datasets with AI-based approaches
Aits, S. (PI), Åström, K. (PI), Maad Sasane, S. (PI), Oskolkov, N. (Forskare), Simpson, K. (Forskare), Kazemi Rashed, S. (Forskarstuderande) & Lim, J. C. (Forskarstuderande)
2018/11/28 → …
Projekt: Forskning
-
Lysosomal permeabilisering i celldöd - från molekylärer mekanismer till nya behandlingsstrategier för neurologiska sjukdomar
Aits, S. (PI), Ahmed, R. (Forskarstuderande), Kazemi Rashed, S. (Forskarstuderande) & Oskolkov, N. (Forskare)
Fabrikant Einar Willumsens Mindelegat, Stiftelsen Sigurd och Elsa Goljes Minne, Kungliga Fysiografiska Sällskapet i Lund, Swedish Research Council, Crafoordska stiftelsen, Hjärnfonden, Stiftelsen Längmanska kulturfonden, Thorsten och Elsa Segerfalks Stiftelse för främjande av medicinsk vetenskaplig forskning och utbildning
2017/01/01 → 2023/12/31
Projekt: Forskning
-
Biomedical text mining for systems biology
Aits, S. (Forskare), Nugues, P. (PI), Frid, J. (Forskare), Klang, M. (Forskare), Ahmed, R. (Forskare) & Kazemi Rashed, S. (Forskare)
2019/04/01 → …
Projekt: Forskning
Aktiviteter
-
Grand Seminar - AI for Biodiversity and Climate Research
Ek, T. (Roll ej angiven), Sopasakis, A. (huvudtalare), Mogren, O. (huvudtalare), Pettersson, L. B. (huvudtalare), Carlson, J. (huvudtalare), Silvestro, D. (huvudtalare), Haider, J. (huvudtalare), Sterner, E. (huvudtalare), Aits, S. (huvudtalare), White, J. (huvudtalare) & Sopasakis, A. (ordförande)
2026 jan. 20Aktivitet: Deltagit i eller arrangerat evenemang › Organiserat av föreläsning/debatt/seminarium för allmänheten
-
Grand Seminar - AI for Biodiversity and Climate Research
Sopasakis, A. (presentatör), Mogren, O. (presentatör), Pettersson, L. B. (presentatör), Carlson, J. (presentatör), Silvestro, D. (presentatör), Haider, J. (presentatör), Sterner, E. (Roll ej angiven), Aits, S. (Roll ej angiven), White, J. (Roll ej angiven), Ek, T. (organisatör), Madjidian, J. (organisatör), Rydälv, C. (organisatör), Nikoleris, L. (organisatör), Wihlborg, A.-K. (presentatör) & Sjöström, C. (organisatör)
2026 jan. 20Aktivitet: Deltagit i eller arrangerat evenemang › Arrangerat workshop/ seminarium/ kurs
-
Artificial intelligence approaches for mapping the nexus of biodiversity, climate change and human society
Aits, S. (Roll ej angiven)
2025 okt. 22Aktivitet: Föredrag eller presentation › Inbjuden talare
-
Natural and Artificial Cognition IV
Åström, K. (talare), Beleyur, T. (talare), Athanasopoulos, P. (talare), Bramao, I. (talare), Wengström, E. (talare), Howes, C. (talare), Tekkesinoglu, S. (talare), Gäfvert, M. (talare), Nijdam, A. (talare), Malik, M. (talare), Scotcher, J. (talare), Akbuga, E. (talare), Gullstrand Heander, L. (talare), Aits, S. (talare), Bäck, H. (talare), Larsson, V. (talare), Bossetta, M. (talare), Dutceac Segesten, A. (talare), Rantzer, A. (talare), Bäck, H. (organisatör), Wengström, E. (organisatör), Bramao, I. (organisatör), Athanasopoulos, P. (organisatör), Aits, S. (organisatör) & Wisbrant, J. (organisatör)
2025 okt. 7Aktivitet: Deltagit i eller arrangerat evenemang › Organiserat av föreläsning/debatt/seminarium för allmänheten
-
ERC Pitch Session
Rydälv, C. (organisatör), Phillips, J. (Roll ej angiven), Gidlöf, K. (Roll ej angiven), Linke, H. (rådgivare), Conley, D. (rådgivare), Björkdahl, A. (rådgivare), Carton, W. (deltagare), Sporre, M. (deltagare) & Aits, S. (deltagare)
2025 apr. 25Aktivitet: Deltagit i eller arrangerat evenemang › Arrangerat workshop/ seminarium/ kurs
Dataset
-
Files and code for English dictionaries, gold and silver standard corpora for biomedical natural language processing related to SARS-CoV-2 and COVID-19
Kazemi Rashed, S. (Skapad av), Rafsan Ahmed (Skapad av), Frid, J. (Skapad av) & Sonja Aits (Skapad av), Zenodo, 2025 juni 12
Dataset
-
An annotated high-content fluorescence microscopy dataset with Hoechst 33342-stained nuclei and manually labelled outlines
Arvidsson, M. (Skapad av), Rashed, S. K. (Skapad av) & Aits, S. (Skapad av), Zenodo, 2022 juni 17
Dataset
-
An annotated high-content fluorescence microscopy dataset with EGFP-Galectin-3-stained cells and manually labelled outlines
Kazemi Rashed, S. (Skapad av), Arvidsson, M. (Skapad av), Ahmed, R. (Skapad av) & Aits, S. (Skapad av), Zenodo, 2021 juni 24
Dataset
-
OpenChart-SE: A corpus of artificial Swedish electronic health records for imagined emergency care patients written by physicians in a crowd-sourcing project
Berg, J. (Skapad av), Aasa Ollvik, C. (Skapad av), Appelgren Thorell, B. (Skapad av) & Aits, S. (Skapad av), Zenodo, 2022 dec. 19
Dataset